Predicted poxvirus FEN1-like nuclease required for homologous recombination, double-strand break repair and full-size genome formation
Notice bibliographique
Résumé
Poxviruses encode many if not all of the proteins required for viral genome replication in the cytoplasm of the host cell. In this context, we investigated the function of the vaccinia virus G5 protein because it belongs to the FEN1-like family of nucleases and is conserved in all poxviruses. A vaccinia virus G5 deletion mutant was severely impaired, as the yield of infectious virus was reduced by approximately two orders of magnitude. The mutant virions contained an apparently normal complement of proteins but appeared spherical rather than brick-shaped and contained no detectable DNA. The inability of G5 with substitutions of the predicted catalytic aspartates to complement the deletion mutant suggested that G5 functions as a nuclease during viral DNA replication. Although the amount of viral DNA produced in the absence of G5 was similar to that made by wild-type virus, the mean size was approximately one-fourth of the genome length. Experiments with transfected plasmids showed that G5 was required for double-strand break repair by homologous recombination, suggesting a similar role during vaccinia virus genome replication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».