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Genomic analysis identifies association of <i>Fusobacterium</i> with colorectal carcinoma

2011· article· en· 1 969 citations· W2107097628 sur OpenAlex· 10.1101/gr.126573.111

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Résumé

The tumor microenvironment of colorectal carcinoma is a complex community of genomically altered cancer cells, nonneoplastic cells, and a diverse collection of microorganisms. Each of these components may contribute to carcinogenesis; however, the role of the microbiota is the least well understood. We have characterized the composition of the microbiota in colorectal carcinoma using whole genome sequences from nine tumor/normal pairs. Fusobacterium sequences were enriched in carcinomas, confirmed by quantitative PCR and 16S rDNA sequence analysis of 95 carcinoma/normal DNA pairs, while the Bacteroidetes and Firmicutes phyla were depleted in tumors. Fusobacteria were also visualized within colorectal tumors using FISH. These findings reveal alterations in the colorectal cancer microbiota; however, the precise role of Fusobacteria in colorectal carcinoma pathogenesis requires further investigation.

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La notice

Revue
Genome Research
Thématique
Gut microbiota and health
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
National Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Human Genome Research InstituteUniversity of GuelphNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBroad InstituteAlbert J. Ryan FoundationDamon Runyon Cancer Research Foundation
Mots-clés
FusobacteriaBiologyColorectal cancerFusobacteriumCarcinomaCarcinogenesisFirmicutesCancerGeneticsGeneBacteroides16S ribosomal RNABacteria
Résumé présent dans OpenAlex
oui