Characterization of the <i>cciIR</i> Quorum-Sensing System in <i>Burkholderia cenocepacia</i>
Notice bibliographique
Résumé
Several transmissible Burkholderia cenocepacia strains that infect multiple cystic fibrosis patients contain a genomic island designated as the cenocepacia island (cci). The cci contains a predicted N-acylhomoserine lactone (AHL) synthase gene, cciI, and a predicted response regulator gene, cciR. AHL production profiles indicated that CciI catalyzes the synthesis of N-hexanoyl-l-homoserine lactone and minor amounts of N-octanoyl-l-homoserine lactone. The cciI and cciR genes were found to be cotranscribed by reverse transcription-PCR analysis, and the expression of a cciIR::luxCDABE fusion in a cciR mutant suggested that the cciIR system negatively regulates its own expression. B. cenocepacia strains also have a cepIR quorum-sensing system. Expression of cepI::luxCDABE or cepR::luxCDABE fusions in a cciR mutant showed that CciR negatively regulates cepI but does not regulate cepR. Expression of the cciIR::luxCDABE fusion in a cepR mutant indicated that functional CepR is required for cciIR expression. Phylogenetic analysis suggested that the cciIR system was acquired by horizontal gene transfer from a distantly related organism and subsequently incorporated into the ancestral cepIR regulatory network. Mutations in cciI, cciR, cepI cciI, and cepR cciR were constructed in B. cenocepacia K56-2. The cciI mutant had greater protease activity and less swarming motility than the parent strain. The cciR mutant had less protease activity than the parent strain. The phenotypes of the cepI cciI and cepR cciR mutants were similar to cepI or cepR mutants, with less protease activity and swarming motility than the parent strain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».