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Enregistrement W2141659194 · doi:10.1158/0008-5472.can-07-1525

Egr-1 Mediates Hypoxia-Inducible Transcription of the <i>NDRG1</i> Gene through an Overlapping Egr-1/Sp1 Binding Site in the Promoter

2007· article· en· W2141659194 sur OpenAlexaff
Ping Zhang, Kam-Meng Tchou-Wong, Max Costa

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésMolecular biologyTransactivationGene knockdownTranscription factorPromoterBiologyElectrophoretic mobility shift assayGene expressionTranscription (linguistics)GeneBinding siteTransfectionResponse elementMessenger RNAChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N-myc down-regulated gene 1 (NDRG1/Cap43) is inducible by a variety of environmental stressors, including hypoxia. The present study identified a cis-acting element mediating the transactivation of the NDRG1 gene in murine RAW264.7 macrophage cells treated with hypoxia or deferoxamine, an iron chelator mimicking hypoxia. Through a series of deletions of the promoter of NDRG1 luciferase constructs, a minimal cis-acting element conferring inducibility by hypoxia and deferoxamine was localized to an early growth response 1 (Egr-1) and Sp1 overlapping binding site. Electrophoretic mobility shift assay, antibody supershift assay, and mutations of the Egr-1 binding site confirmed the specific binding of Egr-1 protein to this Egr-1/Sp1 motif. In addition, hypoxia increased the level of Egr-1 protein that correlated with induction of NDRG1 expression at both RNA and protein levels. Transient transfection of the Egr-1 gene into HeLa cells also resulted in up-regulation of the NDRG1 mRNA. The role of Egr-1 was further verified by mutations in the Egr-1 binding site, which reduced promoter inducibility by hypoxia and deferoxamine. Furthermore, the induction of NDRG1 expression by hypoxia and deferoxamine was diminished by RNA interference knockdown of Egr-1 gene expression and in Egr-1-/- mouse embryonic fibroblasts (MEF) compared with Egr-1+/- MEFs. These results showed for the first time that Egr-1 regulates NDRG1 transcription through an overlapping Egr-1/Sp1 binding site that acts as a major site of positive regulation of the NDRG1 promoter by hypoxia signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,414

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations72
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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