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Enregistrement W2145796537 · doi:10.1093/hmg/ddp352

p38 Mitogen-activated protein kinase stabilizes SMN mRNA through RNA binding protein HuR

2009· article· en· W2145796537 sur OpenAlexafffund
Faraz Farooq, Sylvia Balabanian, Xuejun Liu, Martin Holčı́k, Alex MacKenzie

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensAgricultural Research Institute of OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFightSMAMuscular Dystrophy AssociationEli Lilly and CompanySpinal Muscular Atrophy Foundation
Mots-clésSMN1AnisomycinBiologySpinal muscular atrophySMA*Protein kinase ACell biologyMolecular biologyMessenger RNAProtein biosynthesisGeneKinaseBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spinal muscle atrophy (SMA) is an autosomal recessive neurodegenerative disease which is characterized by the loss of alpha motor neurons resulting in progressive muscle atrophy. Reduced amount of functional survival motor neuron (SMN) protein due to mutations or deletion in the SMN1 gene is the cause of SMA. A potential treatment strategy for SMA is to upregulate levels of SMN protein originating from the SMN2 gene compensating in part for the absence of functional SMN1 gene. Although there exists a sizeable literature on SMN2 inducing compounds, there is comparatively less known about the signaling pathways which modulate SMN levels. Here, we report a significant induction in SMN mRNA and protein following p38 activation by Anisomycin. We demonstrate that Anisomycin activation of p38 causes a rapid cytoplasmic accumulation of HuR, a RNA binding protein which binds to and stabilizes the AU-rich element within the SMN transcript. The stabilization of SMN mRNA, rather than transcriptional induction results in an increase in SMN protein. Our demonstration of SMN protein regulation through the p38 pathway and the role of HuR in this modulation may help in the identification and characterization of p38 pathway activators as potential therapeutic compounds for the treatment of SMA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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