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Enregistrement W2147172531 · doi:10.1128/jcm.43.6.2844-2849.2005

Community-Wide Outbreaks of Clonally Related CTX-M-14 β-Lactamase-Producing <i>Escherichia coli</i> Strains in the Calgary Health Region

2005· article· en· W2147172531 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of CalgaryCalgary Laboratory Services
Organismes subventionnairesUniversity of Calgary
Mots-clésPulsed-field gel electrophoresisBiologyEscherichia coliMicrobiologyMolecular epidemiologyOutbreakEnterobacteriaceaeGenotypeRestriction enzymeDNA profilingGeneticsVirologyGeneDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enterobacteriaceae producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) typically cause nosocomial infections. Previous surveillance in the Calgary Health Region showed that Escherichia coli strains producing ESBLs were common among community patients. During the period (2000 to 2002): 23 of 157 (15%) of the strains were positive for blaCTX-M genes from the CTX-M-I group (CTX-M-1-like) and 87 of 157 (55%) of the strains were positive for blaCTX-M genes from the CTX-M-III group (CTX-M-14-like). The objective of this study was to investigate the molecular epidemiology of these strains. The beta-lactamases were characterized, and the genetic relatedness of the isolates was analyzed by digesting genomic DNA with the restriction endonuclease XbaI and by performing pulse-field gel electrophoresis (PFGE). PFGE revealed two closely related restriction patterns (clusters CTXM14A and CTXM14AR) among 67 (77%) CTX-M-14 producers. These strains from CTXM14A had nearly identical susceptibility patterns and were isolated most often from urine samples obtained at community sites during 2000 and 2001. Strains from the CTX-M-1-like and CTX-M-negative groups were unrelated to clusters CTXM14, CTXM14AR, and CTXM14NR. We conclude that clonally related strains of E. coli producing CTX-M-14 beta-lactamases were responsible for a predominantly community-wide outbreak. Further studies are warranted to investigate whether community-onset diseases caused by ESBL-producing E. coli are related to a point source or transmission within the community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,804
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle