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Enregistrement W2152061559 · doi:10.1038/nature12477

Signatures of mutational processes in human cancer

2013· article· en· W2152061559 sur OpenAlexafffund
Ludmil B. Alexandrov, Serena Nik‐Zainal, David C. Wedge, Samuel Aparício, Sam Behjati, Andrew V. Biankin, Graham R. Bignell, Niccolò Bolli, Åke Borg, Anne‐Lise Børresen‐Dale, Sandrine Boyault, Birgit Burkhardt, Adam P. Butler, Carlos Caldas, Helen Davies, Christine Desmedt, Roland Eils, Jórunn E. Eyfjörd, John A. Foekens, Mel Greaves, Fumie Hosoda, Barbara Hutter, Tomislav Ilicic, Sandrine Imbeaud, Marcin Imieliński, Natalie Jäger, David Jones, David R. Jones, Stian Knappskog, Marcel Kool, Sunil R. Lakhani, Carlos López-Otı́n, Sancha Martin, Nikhil C. Munshi, Hiromi Nakamura, Paul A. Northcott, Marina Pajic, Elli Papaemmanuil, Angelo Paradiso, John V. Pearson, Xosé S. Puente, Keiran Raine, Manasa Ramakrishna, Andrea L. Richardson, Julia Richter, Philip Rosenstiel, Matthias Schlesner, Ton N. Schumacher, Paul N. Span, Jon W. Teague, Yasushi Totoki, Andrew Tutt, Rafael Valdés‐Mas, Marit M. van Buuren, Laura van ‘t Veer, Anne Vincent‐Salomon, Nicola Waddell, Lucy Yates, Jessica Zucman‐Rossi, P. Andrew Futreal, Ultan McDermott, Peter Lichter, Matthew Meyerson, Sean M. Grimmond, Reiner Siebert, Elı́as Campo, Tatsuhiro Shibata, Stefan M. Pfister, Peter J. Campbell, Michael R. Stratton

Notice bibliographique

RevueNature · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of British Columbia HospitalCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCancer Research UK Cambridge Institute, University of CambridgeNational Cancer InstituteLabex Immuno-OncologyBC Cancer AgencyMedisinske fakultet, Universitetet i OsloUniversitat de BarcelonaHáskóli ÍslandsUniversitetet i OsloUniversity of GlasgowInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleWellcome TrustAgence Nationale de la RechercheCancer Research UKBroad InstituteUniversity of New South WalesCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreLunds UniversitetDeutsches Krebsforschungszentrum
Mots-clésCancerComputational biologyHuman genomeBiologyGeneticsGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10 140
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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