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Enregistrement W2155856207 · doi:10.1371/journal.pgen.1004474

Genome Wide Association Identifies Common Variants at the SERPINA6/SERPINA1 Locus Influencing Plasma Cortisol and Corticosteroid Binding Globulin

2014· review· en· W2155856207 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2014
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal Regulation and Hypertension
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingBiocenter, University of OuluCanadian Institutes of Health ResearchNovo Nordisk FondenUppsala UniversitetOulun YliopistoMedical Research CouncilSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöHjärt-LungfondenNovo NordiskJuho Vainion SäätiöNational Health and Medical Research CouncilEmil Aaltosen SäätiöVetenskapsrådetMinistero della SaluteUniversity of BristolNierstichtingStiftelsen för Strategisk ForskningAkademiska SjukhusetAcademy of FinlandWomen and Infants Research FoundationRaine Medical Research FoundationCurtin University of TechnologyHelsingin YliopistoEuropean CommissionBristol-Myers SquibbRoyal SocietyScottish GovernmentBritish Heart FoundationNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustEuropean Science Foundation
Mots-clésTranscortinBiologyGenome-wide association studyHeritabilityGeneticsSingle-nucleotide polymorphismGenetic variationLocus (genetics)Quantitative trait locusEndocrinologyInternal medicineGlobulinGeneGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Variation in plasma levels of cortisol, an essential hormone in the stress response, is associated in population-based studies with cardio-metabolic, inflammatory and neuro-cognitive traits and diseases. Heritability of plasma cortisol is estimated at 30-60% but no common genetic contribution has been identified. The CORtisol NETwork (CORNET) consortium undertook genome wide association meta-analysis for plasma cortisol in 12,597 Caucasian participants, replicated in 2,795 participants. The results indicate that <1% of variance in plasma cortisol is accounted for by genetic variation in a single region of chromosome 14. This locus spans SERPINA6, encoding corticosteroid binding globulin (CBG, the major cortisol-binding protein in plasma), and SERPINA1, encoding α1-antitrypsin (which inhibits cleavage of the reactive centre loop that releases cortisol from CBG). Three partially independent signals were identified within the region, represented by common SNPs; detailed biochemical investigation in a nested sub-cohort showed all these SNPs were associated with variation in total cortisol binding activity in plasma, but some variants influenced total CBG concentrations while the top hit (rs12589136) influenced the immunoreactivity of the reactive centre loop of CBG. Exome chip and 1000 Genomes imputation analysis of this locus in the CROATIA-Korcula cohort identified missense mutations in SERPINA6 and SERPINA1 that did not account for the effects of common variants. These findings reveal a novel common genetic source of variation in binding of cortisol by CBG, and reinforce the key role of CBG in determining plasma cortisol levels. In turn this genetic variation may contribute to cortisol-associated degenerative diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,957
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle