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Enregistrement W2157237731 · doi:10.1093/hmg/ddv252

Genetic determinants of telomere length and risk of common cancers: a Mendelian randomization study

2015· article· en· W2157237731 sur OpenAlexaff
Chenan Zhang, Jennifer A. Doherty, Stephen Burgess, Sara Lindström, Peter Kraft, Jian Gong, Christopher I. Amos, Thomas A. Sellers, Álvaro N.A. Monteiro, Georgia Chenevix‐Trench, Heike Bickeböller, Angela Risch, Paul Brennan, James McKay, Richard S. Houlston, Maria Teresa Landi, Maria Timofeeva, Yufei Wang, Joachim Heinrich, Zsofia Kote‐Jarai, Rosalind A. Eeles, Ken Muir, Fredrik Wiklund, Henrik Grönberg, Sonja I. Berndt, Stephen J. Chanock, Fredrick R. Schumacher, Christopher A. Haiman, Brian E. Henderson, Ali Amin Al Olama, Irene L. Andrulis, John L. Hopper, Jenny Chang‐Claude, Esther M. John, Kathleen E. Malone, Marilie D. Gammon, Giske Ursin, Alice S. Whittemore, David J. Hunter, Stephen B. Gruber, Julia A. Knight, Lifang Hou, Loı̈c Le Marchand, Polly A. Newcomb, Thomas J. Hudson, Andrew T. Chan, Li Li, Michael O. Woods, Habibul Ahsan, Brandon L. Pierce

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandOntario Institute for Cancer ResearchPublic Health OntarioUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute on AgingCancer Research UKUniversity of CambridgeNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesNational Cancer InstituteBritish Heart FoundationNational Center for Advancing Translational SciencesNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustWorld Health Organization
Mots-clésMendelian randomizationConfoundingOncologyOdds ratioSingle-nucleotide polymorphismLung cancerInternal medicineMedicineGenetic associationBiologyGeneticsGenotypeGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epidemiological studies have reported inconsistent associations between telomere length (TL) and risk for various cancers. These inconsistencies are likely attributable, in part, to biases that arise due to post-diagnostic and post-treatment TL measurement. To avoid such biases, we used a Mendelian randomization approach and estimated associations between nine TL-associated SNPs and risk for five common cancer types (breast, lung, colorectal, ovarian and prostate cancer, including subtypes) using data on 51 725 cases and 62 035 controls. We then used an inverse-variance weighted average of the SNP-specific associations to estimate the association between a genetic score representing long TL and cancer risk. The long TL genetic score was significantly associated with increased risk of lung adenocarcinoma (P = 6.3 × 10(-15)), even after exclusion of a SNP residing in a known lung cancer susceptibility region (TERT-CLPTM1L) P = 6.6 × 10(-6)). Under Mendelian randomization assumptions, the association estimate [odds ratio (OR) = 2.78] is interpreted as the OR for lung adenocarcinoma corresponding to a 1000 bp increase in TL. The weighted TL SNP score was not associated with other cancer types or subtypes. Our finding that genetic determinants of long TL increase lung adenocarcinoma risk avoids issues with reverse causality and residual confounding that arise in observational studies of TL and disease risk. Under Mendelian randomization assumptions, our finding suggests that longer TL increases lung adenocarcinoma risk. However, caution regarding this causal interpretation is warranted in light of the potential issue of pleiotropy, and a more general interpretation is that SNPs influencing telomere biology are also implicated in lung adenocarcinoma risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,023
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,056
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,122

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0230,056
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations144
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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