Activation-induced cytidine deaminase acts as a mutator in <i>BCR-ABL1</i>–transformed acute lymphoblastic leukemia cells
Notice bibliographique
Résumé
The Philadelphia chromosome (Ph) encoding the oncogenic BCR-ABL1 kinase defines a subset of acute lymphoblastic leukemia (ALL) with a particularly unfavorable prognosis. ALL cells are derived from B cell precursors in most cases and typically carry rearranged immunoglobulin heavy chain (IGH) variable (V) region genes devoid of somatic mutations. Somatic hypermutation is restricted to mature germinal center B cells and depends on activation-induced cytidine deaminase (AID). Studying AID expression in 108 cases of ALL, we detected AID mRNA in 24 of 28 Ph(+) ALLs as compared with 6 of 80 Ph(-) ALLs. Forced expression of BCR-ABL1 in Ph(-) ALL cells and inhibition of the BCR-ABL1 kinase showed that aberrant expression of AID depends on BCR-ABL1 kinase activity. Consistent with aberrant AID expression in Ph(+) ALL, IGH V region genes and BCL6 were mutated in many Ph(+) but unmutated in most Ph(-) cases. In addition, AID introduced DNA single-strand breaks within the tumor suppressor gene CDKN2B in Ph(+) ALL cells, which was sensitive to BCR-ABL1 kinase inhibition and silencing of AID expression by RNA interference. These findings identify AID as a BCR-ABL1-induced mutator in Ph(+) ALL cells, which may be relevant with respect to the particularly unfavorable prognosis of this leukemia subset.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».