MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2235455239

Genetic Variation Among Different Indian Populations of Cabbage Diamondback Moth ( Plutella xylostella ; Lepidoptera: Plutellidae) Based on Mitochondrial DNA

2016· article· en· W2235455239 sur OpenAlexvenueno aff
Rakshit Ojha, S. K. Jalali, J. Poorani, K. Srinivasa Murthy

Notice bibliographique

RevueMolecular Entomology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlutellaBiologyDiamondback mothGenetic variationPlutellidaeMitochondrial DNAHaplotypePhylogenetic treeDNA barcodingGeneticsLepidoptera genitaliaZoologyEcologyGeneGenotype
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plutella xylostella (L.), commonly known as diamondback moth, is one of the most widely distributed and serious pests of cruciferous crops across the world. To examine the pattern and magnitude of genetic variation in this species in India, a fragment of the mitochondrial (mt) Cytochrome C oxidase subunit I ( COXI ) gene of P. xylostella collected from thirteen provinces in India, spanning a geographic area of ~ 12250000 km 2 , was sequenced. Sequence analysis of the 658 bp mt COXI gene from 13 populations resulted in 9 haplotypes, of which 5 populations clustered to form a haplotype group. Among these populations, 11 polymorphic sites were observed, of which 5 were transitional and 6 were of transversional substitution. Phylogenetic analysis in comparison with nucleotide sequences of other countries obtained from GenBank showed that all the populations were highly interrelated. From a geographical perspective, high rates of migration between Indian populations suggest that dispersal of gene flow over considerable distances is a major factor in the development of genetic variability in the species. Nevertheless, we believe that these variations are induced by local selection pressure in insecticide usage, host strain variation and cultural practices. Our study has revealed that Indian populations of P. xylostella are not homogeneous and use of DNA barcoding with more suitable markers can resolve the issues related to the demography of the species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular EntomologyMême sujetInsect Resistance and GeneticsTravaux en français237 207