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Enregistrement W2316261099 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-247

Abstract 247: ADAR1 promotes malignant progenitor reprogramming in chronic myeloid leukemia.

2013· article· en· W2316261099 sur OpenAlexaff
Qingfei Jiang, Leslie Crews, Christian Barrett, Angela Court-Recart, Daniel Goff, Anil Sadarangani, Jessica M. Rusert, Sheldon Morris, Lawrence S.B. Goldstein, Hye-Jung E. Chun, Marco A. Marra, Kelly Fraser, Kim‐Hien Dao, Mark D. Minden, Catriona Jamieson

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReprogrammingMyeloid leukemiaBiologyProgenitor cellCancer researchSmall hairpin RNAStem cellMyeloidLeukemiaGene knockdownImmunologyCell biologyGeneticsCellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The molecular etiology of human progenitor reprogramming into self-renewing leukemia stem cells (LSC) has remained elusive. While DNA sequencing has uncovered spliceosome gene mutations that promote alternative splicing and portend leukemic transformation, isoform diversity may also be generated by RNA editing mediated by adenosine deaminase acting on RNA (ADAR) enzymes that regulate stem cell maintenance. In this study, whole transcriptome sequencing of normal, chronic phase (CP) and serially transplantable blast crisis (BC) chronic myeloid leukemia (CML) progenitors revealed increased interferon-γ pathway gene expression in concert with BCR-ABL amplification, enhanced expression of the interferon responsive ADAR1 p150 isoform and a propensity for increased A-to-I RNA editing during CML progression. Lentiviral overexpression experiments demonstrate that ADAR1 p150 promoted expression of the myeloid transcription factor PU.1 and induced malignant reprogramming of myeloid progenitors. Moreover, enforced ADAR1 p150 expression was associated with production of a mis-spliced form of GSK3β implicated in LSC self-renewal. Finally, functional serial transplantation and shRNA studies demonstrate that ADAR1 knockdown impaired in vivo self-renewal capacity of BC CML progenitors. Together these data provide a compelling rationale for developing ADAR1-based LSC detection and eradication strategies. Citation Format: Qingfei Jiang, Leslie A. Crews, Christian L. Barrett, Angela Court-Recart, Daniel Goff, Anil Sadarangani, Jessica Rusert, Sheldon Morris, Lawrence Goldstein, Hye-Jung Chun, Marco Marra, Kelly Fraser, Kim-Hien Dao, Mark Minden, Catriona Jamieson. ADAR1 promotes malignant progenitor reprogramming in chronic myeloid leukemia. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 247. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-247

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,130
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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