MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2316972784 · doi:10.1107/s0108767308091708

Mechanism for formation of Arg-AMP in help of tRNA on the basis of structure of ArgRS, tRNA and ATP

2008· article· en· W2316972784 sur OpenAlexaff
Masae Konno, Emiko Uchikawa, Yusaku Mori, Tomomi Sumida, T. Yanagisawa, Shun‐ichi Sekine, Shigeyuki Yokoyama

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransfer RNAMechanism (biology)ChemistryBiochemistryRNAPhysicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Poster Sessions in the T-state (inactive; NADH bound). Notably, in the unregulated Type I CS these same residues form a stable folded region composed of two large helices that are a key part of the binding site for acetyl-CoA. Kinetic analyses of both types of CS indicate a similar catalytic mechanism, suggesting that in the active R-state of E. coli Type II CS, the conformation of residues 262-298 will be similar to that seen in the unregulated Type I enzymes. This uniquely evolved functionality switch in the Type II CS provides the opportunity to study a novel aspect of the protein folding problem, namely how to engineer the property of reversible instability into a formerly stably folded region. We have specifically designed and determined the structures of variant enzymes to gain a better understanding of the mechanistic features of this allosterically controlled regulatory folding/unfolding system. This has resulted in a series of stepwise structural snap shots of the refolding process in going from the T to R-states in Type II CS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,709

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueActa Crystallographica Section A Foundations of CrystallographyMême sujetRNA and protein synthesis mechanismsTravaux en français237 207