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Enregistrement W2321350289 · doi:10.1158/1538-7445.am10-2680

Abstract 2680: Nonautoinhibitory properties of the C-terminal helix of the mitogen- and stress-activated protein kinase 1

2010· article· en· W2321350289 sur OpenAlexaff
Hong-Gyum Kim, Margarita Malakhova, I. D’Angelo, Ann M. Bode, Zigang Dong

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophosphorylationMitogen-activated protein kinase kinaseMAP2K7Cyclin-dependent kinase 9c-RafMAP kinase kinase kinaseProtein kinase ACyclin-dependent kinase 2MAPK14Protein kinase domainProtein kinase RChemistryKinaseCell biologyBiochemistryMolecular biologyBiologyMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mitogen- and stress-activated protein kinase 1 (MSK1) is a growth factor-stimulated serine/threonine kinase that is important in the regulation of gene transcription and proinflammatory cytokine stimulation. MSK1 is a dual kinase possessing two distinct kinase domains linked by a hydrophobic region. The C-terminal kinase domain (CTD MSK1) is an important regulatory domain activated by ERKs and p38 mitogen-activated protein kinases (MAPKs) in response to various cellular stimuli. The activity of full length MSK1 is controlled by multiple phosphorylation sites and is mediated through stimulation of the C-terminal kinase domain. We have determined the crystal structure of the isolated active CTD MSK1 (residues 414-738) in apo- form and in complex with the non-hydrolyzable ATP analogue AMP-PNP at 2.0 and 2.5 Å resolution, respectively. The structure showed that, despite overall similarity with the p90 ribosomal S6 kinase 2 (RSK2) and the MAPK-activated protein kinase 2 (MK2), the CTD MSK1 is unexpectedly not autoinhibited by the C-terminal αL-helix. The helix does not form hydrogen bonds with a substrate-binding loop and nearby helices and lacks putative “inhibitory” residues responsible for the interaction with the kinase core. CTD MSK1 undergoes active autophosphorylation in vitro as shown by luminescent assay, and mutation of two residues, H712K and F719Y, located on the αL-helix does not convert it to RSK2-like autoinhibitory state. The protein was phosphorylated at Thr581 in the T-activation loop, and a T581A mutant showed significantly impaired autokinase activity. The “full length” C-terminal domain of MSK1 (residues 414-802) possessed weaker autophosphorylation activity compared with the truncated fragment (residues 414-738), which lacks the MAPK-docking site. Overexpression of active truncated CTD MSK1 (residues 414-738) in JB6 cells resulted in neoplastic transformation in response to EGF or TPA stimulation in a manner similar to that induced by the full length MSK1. On the other hand, the “full length” CTD (residues 414-802) suppressed colony formation ex vivo. This results indicate that the extreme C-terminal tail (residues 739-802), which encloses the ERK/p38 docking site, inhibits CTD MSK1 kinase activity. Using surface plasmon resonance (SPR) binding experiments, we showed that the C-terminal end-deleted construct does not interact with ERK1 in vitro, but the “full length” CTD MSK1 binds with ERK1 in a dose-dependent manner with a KD ∼ 70 nM. Similar binding results were obtained for interaction with ERK2 and p38. The SPR data indicate that the αL-helix is not involved in the interaction with MAP kinases. The intrinsic non-autoinhibitory C-terminal αL-helix feature suggests that the CTD has a αL-helix-independent activation mechanism, and the MAPK-docking site may regulate CTD MSK1 activity. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 101st Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2010 Apr 17-21; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2010;70(8 Suppl):Abstract nr 2680.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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