MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2328985452 · doi:10.1097/00054725-200912002-00172

The A4-Fla2 flagellin, a dominant antigen in Crohnʼs Disease, is a poor TLR5 agonist

2009· article· en· W2328985452 sur OpenAlexaff
Theodore S. Steiner, Sabine Ivison, C Wang, C. J. Elson

Notice bibliographique

RevueInflammatory Bowel Diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCrohn's and Colitis Foundation of America
Mots-clésTLR5FlagellinImmunologyMicrobiologyAntigenBiologyColitisAntibodyInflammatory bowel diseaseReceptorMedicineToll-like receptorImmune systemInternal medicineDiseaseInnate immune systemBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Approximately half of patients with Crohn's disease (CD) have measurable serum antibodies to CBir1, a flagellin protein from a nonculturable member of the Lachnospiraceae group of Clostridiales order bacteria. A taxonomically related organism, designated A4, is found in high numbers in the normal mouse colon and expresses a flagellin, Fla2, which also strongly reacts with CD sera. Inflammatory responses to flagellin in the intestinal epithelium are mediated by Toll-like receptor 5 (TLR5) but the role of TLR5 in the generation of pathologic anti-flagellin antibodies in CD remains unknown and has been called into doubt by recent findings that TLR5 is not required for the colitigenic effects of flagellin in the DSS colitis model. It has previously been reported that CBir1 causes cytokine release from hemopoietic cells, but its direct TLR5 agonist activity has never been quantified. To determine if Fla2 and other flagellins that react with CD sera have different TLR5-stimulatory activity than flagellins from Enterobacteriaceae. 1) Recombinant Fla2 and E. coli FliC were used to stimulate HEK 293T cells transiently expressing murine or human TLR5, and IL-8 and CCL20 production were measured. 2) C57Bl/6 mice were injected intraperitoneally with Fla2 or FliC, and serum IL-8 measured after 3h. 3) The fla2 and fliC genes were cloned into a low-copy expression system under control of the native E. coli fliC promoter in E. coli with a chromosomal fliC deletion, and motility was measured. As previously reported, FliC was a potent agonist for both human and murine TLR5 in HEK 293T cells, with an EC50 of 1-5 ng/ml. In contrast, Fla2 was a much weaker agonist, with an EC50 of 100-500 ng/ml for murine TLR5, and greater than 1 μg/ml for human TLR5. This potency difference was also evident in the in vivo model, where IL-6 production was markedly higher in FliC treated mice (4332±1563 pg/ml) than in Fla2-treated mice (111±66 pg/ml). Finally, unlike FliC, Fla2 was unable to confer motility to E. coli:fliC- in the native expression system. Motility of the A4 organism itself was not measured due to the requirement for strict anaerobic conditions. The A4-Fla2 flagellin is a poor agonist for TLR5, with higher activity for murine than human TLR5. This manifests in vivo as a weak inflammatory response to IP injection compared to E. coli FliC. Fla2 also appears to lack the ability to confer motility to E. coli, although the motility of the native A4 strain remains unknown. These results support the hypothesis that TLR5 stimulation and the development of pathological adaptive immune responses in IBD may be inversely correlated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInflammatory Bowel DiseasesMême sujetInflammatory Bowel DiseaseTravaux en français237 207