<i>C</i><sup>8</sup>-Heteroaryl-2′-deoxyguanosine Adducts as Conformational Fluorescent Probes in the <i>Nar</i>I Recognition Sequence
Notice bibliographique
Résumé
The optical, redox, and electronic properties of C(8)-heteroaryl-2'-deoxyguanosine (dG) adducts with C(8)-substituents consisting of furyl ((Fur)dG), pyrrolyl ((Pyr)dG), thienyl ((Th)dG), benzofuryl ((Bfur)dG), indolyl ((Ind)dG), and benzothienyl ((Bth)dG) are described. These adducts behave as fluorescent nucleobase probes with emission maxima from 379 to 419 nm and fluorescence quantum yields (Φ(fl)) in the 0.1-0.8 range in water at neutral pH. The probes exhibit quenched fluorescence with increased solvent viscosity and decreased solvent polarity. The (Fur)dG, (Bfur)dG, (Ind)dG, and (Bth)dG derivatives were incorporated into the G(3) position of the 12-mer oligonucleotide 5'-CTCG(1)G(2)CG(3)CCATC-3' that contains the recognition sequence of the NarI Type II restriction endonuclease. This sequence is widely used to study the biological activity (mutagenicity) of C(8)-arylamine-dG adducts with adduct conformation (anti vs syn) playing a critical role in the biological outcome. The modified NarI(X = (Fur)G, (Ind)G, (Bfur)G, or (Bth)G) oligonucleotides were hybridized to the complementary strand containing either C (NarI'(C)) or G (NarI'(G)) opposite the probe. The duplex structures were characterized by UV melting temperature analysis, fluorescence spectroscopy, collisional fluorescence quenching studies, and circular dichroism (CD). The emission of the probes showed sensitivity to the opposing base in the duplex, and suggested the utility of fluorescence spectroscopy to monitor probe conformation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».