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Enregistrement W2515138490 · doi:10.1002/ijc.30288

Telomere structure and maintenance gene variants and risk of five cancer types

2016· review· en· W2515138490 sur OpenAlexaff
Sara Karami, Younghun Han, Mala Pande, Iona Cheng, James Rudd, Brandon L. Pierce, Ellen L. Nutter, Fredrick R. Schumacher, Zsofia Kote‐Jarai, Sara Lindström, John S. Witte, Shenying Fang, Jiali Han, Peter Kraft, David J. Hunter, Fengju Song, James McKay, Stephen B. Gruber, Stephen J. Chanock, Angela Risch, Hongbing Shen, Christopher A. Haiman, Cornelia M. Ulrich, Graham Casey, Ulrike Peters, Ali Amin Al Olama, Andrew Berchuck, Sonja I. Berndt, Stéphane Bezieau, Paul Brennan, Hermann Brenner, Louise A. Brinton, Neil E. Caporaso, Andrew T. Chan, Jenny Chang‐Claude, David C. Christiani, Julie M. Cunningham, Douglas F. Easton, Rosalind A. Eeles, Timothy Eisen, Manish Gala, Steven Gallinger, Simon A. Gayther, Ellen L. Goode, Henrik Grönberg, Brian E. Henderson, Richard S. Houlston, Amit D. Joshi, Sébastien Küry, Mari T. Landi, Loı̈c Le Marchand, Kenneth Muir, Polly A. Newcomb, Jenny Permuth‐Wey, Paul D.P. Pharoah, Catherine Phelan, John D. Potter, Susan J. Ramus, Harvey A. Risch, Joellen M. Schildkraut, Martha L. Slattery, Honglin Song, Nicolas Wentzensen, Emily White, Fredrik Wiklund, Brent W. Zanke, Thomas A. Sellers, Wei Zheng, Nilanjan Chatterjee, Christopher I. Amos, Jennifer A. Doherty

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2016
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of OttawaLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoInstitute of Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKNational Institute on AgingFrancis Crick InstituteNational Human Genome Research InstituteWorld Health Organization
Mots-clésTelomereBiologySingle-nucleotide polymorphismProstate cancerProstateColorectal cancerBreast cancerOncologyTelomerase reverse transcriptaseCancerLung cancerInternal medicineCancer researchTelomeraseGeneGeneticsMedicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Telomeres cap chromosome ends, protecting them from degradation, double‐strand breaks, and end‐to‐end fusions. Telomeres are maintained by telomerase, a reverse transcriptase encoded by TERT , and an RNA template encoded by TERC . Loci in the TERT and adjoining CLPTM1L region are associated with risk of multiple cancers. We therefore investigated associations between variants in 22 telomere structure and maintenance gene regions and colorectal, breast, prostate, ovarian, and lung cancer risk. We performed subset‐based meta‐analyses of 204,993 directly‐measured and imputed SNPs among 61,851 cancer cases and 74,457 controls of European descent. Independent associations for SNP minor alleles were identified using sequential conditional analysis (with gene‐level p value cutoffs ≤3.08 × 10 −5 ). Of the thirteen independent SNPs observed to be associated with cancer risk, novel findings were observed for seven loci. Across the DCLRE1B region, rs974494 and rs12144215 were inversely associated with prostate and lung cancers, and colorectal, breast, and prostate cancers, respectively. Across the TERC region, rs75316749 was positively associated with colorectal, breast, ovarian, and lung cancers. Across the DCLRE1B region, rs974404 and rs12144215 were inversely associated with prostate and lung cancers, and colorectal, breast, and prostate cancers, respectively. Near POT1 , rs116895242 was inversely associated with colorectal, ovarian, and lung cancers, and RTEL1 rs34978822 was inversely associated with prostate and lung cancers. The complex association patterns in telomere‐related genes across cancer types may provide insight into mechanisms through which telomere dysfunction in different tissues influences cancer risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil0,671

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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