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Enregistrement W2549871051 · doi:10.1038/ncomms13419

Altered intestinal microbiota–host mitochondria crosstalk in new onset Crohn’s disease

2016· article· en· W2549871051 sur OpenAlexafffund
Walid Mottawea, Cheng‐Kang Chiang, Marcus Mühlbauer, Amanda E. Starr, James Butcher, Turki S. Abujamel, Shelley A. Deeke, Annette Brandel, Hu Zhou, Shadi Shokralla, Mehrdad Hajibabaei, Ruth Singleton, Eric I. Benchimol, Christian Jobin, David Mack, Daniel Figeys, Alain Stintzi

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of GuelphUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCenter for Gastrointestinal Biology and Disease, School of Medicine, University of North Carolina at Chapel HillNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchMansoura UniversityMinistero dello Sviluppo EconomicoCrohn's and Colitis CanadaSaudi Arabian Cultural BureauOntario Ministry of Economic Development and InnovationGovernment of CanadaOntario Genomics InstituteCanadian Child Health Clinician Scientist ProgramUniversity of OttawaNational Institutes of HealthOntario GenomicsCrohn's and Colitis Foundation of AmericaGenome CanadaKing Abdulaziz UniversityCanadian Association of Gastroenterology
Mots-clésDysbiosisBiologyCrosstalkGut floraColitisCrohn's diseasePhenotypeImmunologyInflammatory bowel diseaseDiseaseMicrobiomePathogenesisMicrobiologyGeneticsMedicineGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Intestinal microbial dysbiosis is associated with Crohn’s disease (CD). However, the mechanisms leading to the chronic mucosal inflammation that characterizes this disease remain unclear. In this report, we use systems-level approaches to study the interactions between the gut microbiota and host in new-onset paediatric patients to evaluate causality and mechanisms of disease. We report an altered host proteome in CD patients indicative of impaired mitochondrial functions. In particular, mitochondrial proteins implicated in H2S detoxification are downregulated, while the relative abundance of H2S microbial producers is increased. Network correlation analysis reveals that Atopobium parvulum controls the central hub of H2S producers. A. parvulum induces pancolitis in colitis-susceptible interleukin-10-deficient mice and this phenotype requires the presence of the intestinal microbiota. Administrating the H2S scavenger bismuth mitigates A. parvulum-induced colitis in vivo. This study reveals that host–microbiota interactions are disturbed in CD and thus provides mechanistic insights into CD pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations453
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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