Structural, Functional and Dynamic Studies of F Plasmid T4SS Proteins
Notice bibliographique
Résumé
The transfer of genetic material within a bacterial population through the process of conjugation distributes novel genetic elements for survival in unique environments. Bacterial conjugation is important to public health as the spread antibiotic resistance genes among bacteria results in multi-drug resistance. Indeed, approximately 70% of bacteria that cause hospital-acquired infections are resistant to at least one antibiotic. Conjugative systems, such as the F plasmid of Escherichia coli, consist of proteins that share similarities to type IV secretion systems (T4SS). T4SS proteins of the F plasmid form a membrane spanning protein complex and surface exposed pilus. The periplasmic T4SS proteins TraF, TraW and TrbC play important roles during the F pilus assembly and DNA transfer. Functional analysis of a series of TraF mutants has shown that modification to TraF abolishes pilus synthesis and in turn F plasmid conjugation. In addition, dynamic analysis of TraF using time-resolved hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry has revealed a well structured C-terminal thioredoxin-like domain and a more dynamic N-terminal domain that is predicted to interact with companion T4SS protein TraH. In addition, interaction analysis of the putative pore forming proteins TraW and TrbC indicate that the C-terminal domain of TrbC is not required for interaction with TraW, unlike previous models of F T4SS assembly. Rather the C-terminal domain of TraW preferentially interacts with the N-terminal domain of TrbC. These studies are providing a clearer picture of the structures and interactions that occur within the F T4SS assembly during the conjugative process.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».