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Enregistrement W2560135976 · doi:10.1681/asn.2016010069

Genetic Variants Associated with Circulating Parathyroid Hormone

2016· article· en· W2560135976 sur OpenAlexaff
Cassianne Robinson‐Cohen, Pamela L. Lutsey, Marcus E. Kleber, Carrie M. Nielson, Braxton D. Mitchell, Joshua C. Bis, Karen Eny, Laura Portas, Joel Eriksson, Mattias Lorentzon, Daniel L. Koller, Yuri Milaneschi, Alexander Teumer, Stefan Pilz, Maria Nethander, Elizabeth Selvin, Weihong Tang, Lu‐Chen Weng, Hoi Suen Wong, Dongbing Lai, Munro Peacock, Anke Hannemann, Uwe Völker, Georg Homuth, Matthias Nauk, Federico Murgia, Jack Pattee, Eric Orwoll, Joseph M. Zmuda, José A. Riancho, Myles Wolf, Frances M. K. Williams, Brenda W.J.H. Penninx, Michael J. Econs, Kathleen A. Ryan, Claes Ohlsson, Andrew D. Paterson, Bruce M. Psaty, David S. Siscovick, Jerome I. Rotter, Mario Pirastu, Elizabeth A. Streeten, Winfried März, Caroline S. Fox, Josef Coresh, Henri Wallaschofski, James S. Pankow, Ian H. de Boer, Bryan Kestenbaum

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesU.S. National Library of MedicineNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institutes of HealthMinistry of Cultural AffairsRoche Diabetes CareAbbott Diabetes CareUniversitair Medisch Centrum GroningenGöteborgs LäkaresällskapSiemensVetenskapsrådetNovo NordiskBundesministerium für Bildung und ForschungVrije Universiteit AmsterdamStiftelsen för Strategisk ForskningNational Center for Advancing Translational SciencesLeids Universitair Medisch CentrumUniversiteit LeidenInsulet CorporationNiproNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSanofiEuropean CommissionUniversität GreifswaldJohns Hopkins UniversityEli Lilly and CompanyNovo Nordisk FondenFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésParathyroid hormoneCYP24A1Single-nucleotide polymorphismInternal medicineEndocrinologyVitamin D and neurologyMinor allele frequencyBiologySecondary hyperparathyroidismSNPCalcitriol receptorMedicineGenotypeGeneticsCalciumGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parathyroid hormone (PTH) is a primary calcium regulatory hormone. Elevated serum PTH concentrations in primary and secondary hyperparathyroidism have been associated with bone disease, hypertension, and in some studies, cardiovascular mortality. Genetic causes of variation in circulating PTH concentrations are incompletely understood. We performed a genome-wide association study of serum PTH concentrations among 29,155 participants of European ancestry from 13 cohort studies ( n =22,653 and n =6502 in discovery and replication analyses, respectively). We evaluated the association of single nucleotide polymorphisms (SNPs) with natural log-transformed PTH concentration adjusted for age, sex, season, study site, and principal components of ancestry. We discovered associations of SNPs from five independent regions with serum PTH concentration, including the strongest association with rs6127099 upstream of CYP24A1 ( P =4.2 × 10 −53 ), a gene that encodes the primary catabolic enzyme for 1,25-dihydroxyvitamin D and 25-dihydroxyvitamin D. Each additional copy of the minor allele at this SNP associated with 7% higher serum PTH concentration. The other SNPs associated with serum PTH concentration included rs4074995 within RGS14 ( P =6.6 × 10 −17 ), rs219779 adjacent to CLDN14 ( P =3.5 × 10 −16 ), rs4443100 near RTDR1 ( P =8.7 × 10 −9 ), and rs73186030 near CASR ( P =4.8 × 10 −8 ). Of these five SNPs, rs6127099, rs4074995, and rs219779 replicated. Thus, common genetic variants located near genes involved in vitamin D metabolism and calcium and renal phosphate transport associated with differences in circulating PTH concentrations. Future studies could identify the causal variants at these loci, and the clinical and functional relevance of these variants should be pursued.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,971
Score d'incertitude au seuil0,252

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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