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Enregistrement W2565332355 · doi:10.1089/dna.2016.3507

Expression of the Cardiac Maintenance and Survival Factor FGF-16 Gene Is Regulated by Csx/Nkx2.5 and Is an Early Target of Doxorubicin Cardiotoxicity

2016· article· en· W2565332355 sur OpenAlexafffund
Jie Wang, Yan Jin, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesResearch Manitoba
Mots-clésBiologyGene knockdownTranscription factorMolecular biologyFibroblast growth factorSmall interfering RNAGene expressionPromoterDoxorubicinTransfectionGeneBiochemistryGeneticsChemotherapyReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fibroblast growth factor (FGF) 16 gene (Fgf-16) is preferentially expressed by neonatal cardiomyocytes after birth, with levels increasing into adulthood. Null mice and isolated heart studies suggest a role for FGF-16 in cardiac maintenance and survival, including increased resistance to doxorubicin (DOX)-induced injury. However, the effect of DOX on endogenous FGF-16 synthesis and specifically regulation of cardiac Fgf-16 expression has not been reported. Here we assess the effect of DOX on FGF-16 RNA levels and stability as well as promoter activity and use sequence analysis, knockdown, and overexpression to investigate the role of cardiac transcription factor(s) implicated in the response. Endogenous FGF-16 RNA levels were reduced >70% in 8-week-old rats treated with 15 mg DOX/kg for 6 h. This was modeled in neonatal rat cardiomyocyte cultures, where an equivalent decrease was also seen within 6 h of 1 μM DOX treatment. Six kilobases of mouse Fgf-16 upstream flanking and promoter DNA was also assessed for DOX responsiveness in transfected cardiomyocytes. A decrease in FGF-16 promoter activity was seen with only 747 base pairs containing the Fgf-16 TATA box that includes a putative and highly conserved binding site for the cardiac transcription factor Csx/Nkx2.5. There was also no effect of DOX on FGF-16 RNA stability, consistent with transcriptional control. Levels and binding of Csx/Nkx2.5 to the FGF-16 promoter were reduced with DOX treatment. Knockdown of Csx/Nkx2.5 specifically decreased endogenous FGF-16 RNA and protein levels, whereas Csx/Nkx2.5 overexpression stimulated levels, and increased resistance to the rapid DOX-induced depletion of FGF-16. These observations indicate that Fgf-16 expression is directly regulated by Csx/Nkx2.5 in neonatal cardiomyocytes, and a negative effect of DOX on Csx/Nkx2.5 and, thus, endogenous FGF-16 synthesis may contribute indirectly to its cardiotoxic effects. Targeting FGF-16 levels could, however, offer increased resistance to cardiac injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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