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Enregistrement W2587925217 · doi:10.1093/neuonc/now212.893

TMOD-23. DEVELOPMENT AND APPLICATION OF A NOVEL MODEL OF HUMAN LUNG-TO- BRAIN METASTASIS TO IDENTIFY GENETIC REGULATORS OF BRAIN METASTASIS INITIATING CELLS

2016· article· en· W2587925217 sur OpenAlexaff
Mohini Singh, Chitra Venugopal, Tomáš Tokár, Kevin R. Brown, Nicole McFarlane, David Bakhshinyan, Parvez Vora, Maleeha Qazi, Sujeivan Mahendram, Thushyant Vijaykumar, Branavan Manoranjan, Amy H.Y. Tong, Kathrin Durrer, Naresh Murty, Robin Hallet, John A. Hassell, David R. Kaplan, Jean‐Claude Cutz, Igor Jurišica, Jason Moffat, Sheila K. Singh

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensSt. Joseph's HospitalHospital for Sick ChildrenOccupational Cancer Research CentrePrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBrain metastasisMetastasisBiologyCancer researchCancerGene knockdownLung cancerCancer stem cellPathologyMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain Metastases (BM) are the most common type of cerebral tumor in adult, occurring at a rate 10 times greater than that of primary brain cancers. The inherent abilities of a primary tumor cell capable of initiating a BM resembles that of a cancer stem cell (CSCs). We hypothesize that a subgroup of CSCs, termed brain metastasis-initiating cells (BMICs), are responsible for the initiation of BM and are identifiable by an exclusive subset of genes that regulate self-renewal and metastasis. Despite the prevalence and lethality of BM, there is no clinically relevant model that fully reflects metastasis in patients. We recently generated a novel human-mouse xenotransplantation model of BM that allows for interrogation of each phase of the metastatic process from lung to brain, through injection of human patient-derived BMICs into immunocompromised mice. Comprehensive interrogation of human BM using RNA interference screens with subsequent validation in our model identified SPOCK1 and TWIST2 as novel regulators of brain metastasis-initiating cell (BMIC) self-renewal and migration to the brain, respectively. A prospective cohort of primary lung cancer specimens showed SPOCK1 and TWIST2 over-expressed only in patients who ultimately developed BM. Protein-protein interaction network mapping identified novel BMIC regulatory genes with significant prognostic value in lung cancer patients. Specifically, the most significant connector between SPOCK1 and TWIST2, INHBA, a TGF-β ligand found mutated in lung adenocarcinoma, showed reduced expression in BMICs with knockdown of SPOCK1, defining a novel pathway between INHBA, SPOCK1 and TWIST2 and implicating the involvement of the TGF-β signaling pathway in BM development. Our development of a novel preclinical model of BM, through which we have identified several novel BMIC regulators, present potential therapeutic targets that could aid in blockage of the metastatic process, and transform a uniformly fatal systemic disease into a locally controlled and eminently more treatable one.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,753

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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