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Enregistrement W2587948547 · doi:10.1093/neuonc/nox083.164

MEDU-13. CONVERGENCE OF BMI1 AND CHD7 ON ERK SIGNALLING IN MEDULLOBLASTOMA

2017· article· en· W2587948547 sur OpenAlexaff
Sara Badodi, Xinyu Zhang, Adrian M. Dubuc, Michael D. Taylor, Silvia Marino

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBMI1MedulloblastomaBiologyCancer researchCarcinogenesisPolycomb-group proteinsNeural stem cellGene silencingStem cellCell biologyCancerGeneticsRepressorTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Medulloblastoma is the most common malignant paediatric brain tumour and is associated with high morbidity and mortality. Medulloblastomas are currently classified into four distinct molecular subgroups (WNT, SHH, Group 3 and Group 4) with different prognosis and responses to therapy. The Polycomb group protein BMI1 sustains self-renewal of neural stem cells and promotes proliferation of neural progenitors during development and in adult tissue homeostasis. Upregulation of BMI1 has been described in a plethora of cancers, including medulloblastoma, and it correlates with clinical stage and poor prognosis. BMI1 is overexpressed across all medulloblastoma subgroups but it is highest in Group 4 where it sustains tumour growth. Insertional mutagenesis of the T2Onc2 transposon by Sleeping Beauty transposase in glutamatergic progenitors overexpressing BMI1 leads to medulloblastoma formation, while neither Bmi1 over-expression nor T2Onc2 transposition alone drives tumorigenesis. These medulloblastomas show frequent inactivating insertions in the chromatin remodelling factor Chd7 (Chromodomain helicase DNA binding factor 7), suggesting that upregulation of BMI1 together with CHD7 loss of function can cooperate to initiate MB tumorigenesis. A BMI1High;CHD7Low molecular signature is associated with poor prognosis in human medulloblastoma and single copy loss and inactivating mutations of CHD7 are found in medulloblastoma Group 4. Silencing of CHD7 in primary patient-derived Group 4 medulloblastoma cells results in increased proliferation and upregulation of markers characteristic of undifferentiated and highly proliferative progenitors. Notably, we demonstrate that the proliferative phenotype driven by CHD7 knockdown is dependent on BMI1. Finally we show a molecular convergence on ERK signalling mediated by CHD7 and dependent on BMI1 expression. These results shed further light on the role of BMI1 and CHD7 in medulloblastoma pathogenesis and raise the possibility that pharmacological targeting of BMI1 or ERK may be particularly indicated in a subgroup of medulloblastoma with low expression level of CHD7.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
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