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Enregistrement W2765899161 · doi:10.1016/j.celrep.2017.10.015

A Targetable EGFR-Dependent Tumor-Initiating Program in Breast Cancer

2017· article· en· W2765899161 sur OpenAlexafffund
Paul Savage, Alexis Blanchet-Cohen, Timothée Revil, Dunarel Badescu, Sadiq M.I. Saleh, Yu-Chang Wang, Dongmei Zuo, Leah Liu, Nicholas Bertos, Valentina Muñoz-Ramos, Mark Basik, Kevin Petrecca, Jamil Asselah, Sarkis Meterissian, Marie‐Christine Guiot, Atilla Ömeroğlu, Claudia L. Kleinman, Morag Park, Jiannis Ragoussis

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill University and Génome Québec Innovation CentreJewish General HospitalMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéGenome CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreStand Up To CancerMcGill University
Mots-clésGefitinibEpidermal growth factor receptorCancer researchBreast cancerTriple-negative breast cancerEGFR inhibitorsBiologyMetastatic breast cancerCancerMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Therapies targeting epidermal growth factor receptor (EGFR) have variable and unpredictable responses in breast cancer. Screening triple-negative breast cancer (TNBC) patient-derived xenografts (PDXs), we identify a subset responsive to EGFR inhibition by gefitinib, which displays heterogeneous expression of wild-type EGFR. Deep single-cell RNA sequencing of 3,500 cells from an exceptional responder identified subpopulations displaying distinct biological features, where elevated EGFR expression was significantly enriched in a mesenchymal/stem-like cellular cluster. Sorted EGFR hi subpopulations exhibited enhanced stem-like features, including ALDH activity, sphere-forming efficiency, and tumorigenic and metastatic potential. EGFR hi cells gave rise to EGFR hi and EGFR lo cells in primary and metastatic tumors, demonstrating an EGFR-dependent expansion and hierarchical state transition. Similar tumorigenic EGFR hi subpopulations were identified in independent PDXs, where heterogeneous EGFR expression correlated with gefitinib sensitivity. This provides new understanding for an EGFR-dependent hierarchy in TNBC and for patient stratification for therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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