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Enregistrement W2780737922 · doi:10.1038/s41596-021-00588-0

Generic acquisition protocol for quantitative MRI of the spinal cord

2021· article· en· W2780737922 sur OpenAlex
Julien Cohen‐Adad, Eva Alonso‐Ortiz, Mihael Abramovic, Carina Arneitz, Nicole Atcheson, Laura Barlow, Robert Barry, Markus Barth, Marco Battiston, Christian Büchel, Matthew D. Budde, Virginie Callot, Anna Combes, Benjamin De Leener, Maxime Descoteaux, Paulo Loureiro de Sousa, Marek Dostál, Julien Doyon, Adam Dvorak, Falk Eippert, Karla R. Epperson, Kevin Epperson, Patrick Freund, Jürgen Finsterbusch, Alexandru Foias, Michela Fratini, Issei Fukunaga, Claudia A. M. Gandini Wheeler‐Kingshott, Giancarlo Germani, Guillaume Gilbert, Federico Giove, Charley Gros, Francesco Grussu, Akifumi Hagiwara, Pierre-Gilles Henry, Tomáš Horák, Masaaki Hori, James M. Joers, Kouhei Kamiya, Haleh Karbasforoushan, Miloš Keřkovský, Ali Khatibi, Joo-Won Kim, Nawal Kinany, Hagen H. Kitzler, Shannon Kolind, Yazhuo Kong, Paul Kuntke, Nyoman D. Kurniawan, Sławomir Kuśmia, René Labounek, Maria Marcella Laganà, Cornelia Laule, Christine Law, Christophe Lenglet, Tobias Leutritz, Yaou Liu, Sara Llufriú, Sean Mackey, Eloy Martínez‐Heras, Loan Mattera, Igor Nestrašil, Kristin P. O’Grady, Nico Papinutto, Daniel S. Papp, Deborah Pareto, Todd B. Parrish, Anna Pichiecchio, Ferrán Prados, Àlex Rovira, Marc J. Ruitenberg, Rebecca S. Samson, Giovanni Savini, Maryam Seif, Alan C. Seifert, Alex K. Smith, Seth A. Smith, Zachary A. Smith, Elisabeth Solana, Yuichi Suzuki, George Tackley, Alexandra Tinnermann, Jan Valošek, Dimitri Van De Ville, Marios Yiannakas, Kenneth A. Weber, Nikolaus Weiskopf, Richard G. Wise, Patrik O. Wyss, Junqian Xu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Protocols · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensPhilips (Canada)McGill UniversityCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeInternational Collaboration On Repair DiscoveriesUniversity of British ColumbiaUniversité de MontréalUniversité de SherbrookeCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustinePolytechnique MontréalMontreal Neurological Institute and HospitalMila - Quebec Artificial Intelligence Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationEconomic and Social Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchCRIS Cancer FoundationRegione PugliaUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaMinistero della SaluteConcordia UniversityAgentura Pro Zdravotnický Výzkum České RepublikyNational Institutes of HealthRosetrees TrustEuropean CommissionMultiple Sclerosis SocietyBundesministerium für Bildung und ForschungNational Imaging FacilityNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of PennsylvaniaSpinalCure AustraliaUniversity of MinnesotaNational Science FoundationCompute CanadaSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungPolytechnique MontréalWellcome TrustInstitut de Valorisation des DonnéesAstraZenecaNational Center for Advancing Translational SciencesCraig H. Neilsen FoundationMcGill UniversityCanada First Research Excellence FundMax-Planck-Gesellschaft
Mots-clésProtocol (science)Magnetic resonance imagingComputer scienceDiffusion MRIMedicineSpinal cordNeuroimagingMedical physicsNuclear medicineRadiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Quantitative spinal cord (SC) magnetic resonance imaging (MRI) presents many challenges, including a lack of standardized imaging protocols. Here we present a prospectively harmonized quantitative MRI protocol, which we refer to as the spine generic protocol, for users of 3T MRI systems from the three main manufacturers: GE, Philips and Siemens. The protocol provides guidance for assessing SC macrostructural and microstructural integrity: T1-weighted and T2-weighted imaging for SC cross-sectional area computation, multi-echo gradient echo for gray matter cross-sectional area, and magnetization transfer and diffusion weighted imaging for assessing white matter microstructure. In a companion paper from the same authors, the spine generic protocol was used to acquire data across 42 centers in 260 healthy subjects. The key details of the spine generic protocol are also available in an open-access document that can be found at https://github.com/spine-generic/protocols . The protocol will serve as a starting point for researchers and clinicians implementing new SC imaging initiatives so that, in the future, inclusion of the SC in neuroimaging protocols will be more common. The protocol could be implemented by any trained MR technician or by a researcher/clinician familiar with MRI acquisition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,346
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,149
Tête enseignante GPT0,513
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle