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Enregistrement W2789355936 · doi:10.31390/gradschool_dissertations.2425

Evaluating the spatial ecology of anthrax in North America: examining epidemiological components across multiple geographic scales using a GIS-based approach

2006· dissertation· en· W2789355936 sur OpenAlexaboutno aff
Jason K. Blackburn

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueZoonotic diseases and public health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCRDF Global
Mots-clésGeographyWildlifeEcologyOutbreakBacillus anthracisSpatial epidemiologyRange (aeronautics)DisjunctEnvironmental niche modellingHabitatBiosecurityTransmission (telecommunications)Ecological nicheBiologyCartographyPopulationEpidemiologyDemographyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This dissertation explores the spatial ecology and potential pathways of infection of anthrax, Bacillus anthracis, in North America. A multi-scale approach was used to evaluate the components required for disease agent survival in the environment, interactions with wildlife, and the potential role that vectors play in anthrax transmission. First, ecological niche modeling with the Genetic Algorithm for Rule-set Production (GARP) was used to predict the geographic distribution of anthrax in the continental U.S. using case data from outbreaks between 1957 and 2005. These results were then used to produce the first quantitative, continental scale predictions of anthrax in Mexico. At the meso-scale, the route of transmission in white-tailed deer is unknown, despite a large number of outbreaks in wild deer in Texas in recent years (2001 – 2005). To determine the interactions between deer and potential anthrax sources, two pilot studies were conducted on 1) the distribution of biting flies in relation to anthrax cases to evaluate the potential role of hematophagous flies as vectors, and 2) the summer home ranges of deer in relation to fly densities and carcass locations. The results of the GARP studies support the use of the technique for modeling the niche of this disease and suggest a central corridor of anthrax habitat from southwest Texas to the Canadian border, with disjunct areas in the Pacific Northwest and California. Mexico’s predicted areas were extensions of the Texas and California ranges. The deer study suggests that deer interactions with spores occur within a limited home range in Texas and long-distance movement of spores is unlikely by individual deer. Biting fly densities were highest in areas of known anthrax infection and lowest in areas where case-positive deer have not been identified, suggesting that flies may play a role in disease transmission, either through mechanical transmission or through increased nuisance that leads to immuno-suppression in deer. This dissertation presents the first continental-scale predictions for the geographic distribution of anthrax in the U.S. and Mexico. Additionally, this is the first known study to evaluate spatial patterns between known cases, fly densities, and animal movements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,965
Score d'incertitude au seuil0,070

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,156
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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