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Enregistrement W2790232800 · doi:10.1093/jcag/gwy008.291

A290 THE ATF6 ARM OF ER STRESS ANTAGONIZES METABOLIC STRESS-INDUCED DECREASES IN EPITHELIAL BARRIER FUNCTION TO COMMENSAL BACTERIA BY PROMOTING XENOPHAGY

2018· article· en· W2790232800 sur OpenAlexaff
Fernando Lopes, Åsa V. Keita, José Luis Reyes, Nicole L. Mancini, Ala Al Rajabi, Alpana Saxena, A Wang, Rob van Dalen, Wallace K. MacNaughton, Humberto Jijon, J D Söderholm, Dana J. Philpott, Derek M. McKay

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFunction (biology)BacteriaStress (linguistics)Cell biologyUnfolded protein responseBiologyMicrobiologyEndoplasmic reticulumGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The barrier function of the intestinal epithelium is a first-line of defense that is compromised in IBD. We have shown that epithelia treated with dinitrophenol (DNP: uncouples oxidative phosphorylation) have a dramatic impairment in their barrier function, and internalize non-invasive commensal E. coli. Mitochondria do not function in isolation; they are closely aligned with the endoplasmic reticulum (ER). To investigate the interaction of mitochondrial dysfunction, ER stress and autophagic processes as a key determinant of epithelial-bacterial interaction, transcellular permeability and the fate of commensal bacteria that gain access to the intracellular compartment as a consequence of metabolic stress. Human colonic biopsies were mounted in Ussing chambers, murine epithelial colonic organoids were re-suspended and grown as a monolayer, and human colon-derived epithelial cell lines were cultured on transwell filters or on plastic. Bacteria were added to the luminal buffer and the tissue treated with DNP ± the ER stressor, tunicamycin (TM), and bacterial internalization and translocation assessed. Mechanistic studies involved measuring ATP production, immunoblotting, assessment of LC3 activation for autophagy and gene knock-down (KD) by siRNA and CRISPR/cas9. DNP promoted the translocation and internalization of E. coli and, remarkably, TM reduced this barrier defect. TM did not prevent the DNP-evoked drop in ATP or the rate of epithelial update of inert beads, but E. coli, DNP and TM-treated cells had increased autophagy. The effect of TM was lost in cells lacking the autophagy protein, ATG16L1, suggesting that the ER-stress promoted killing of the internalized bacteria. Of the 3 major arms of the ER stress response, only KD of ATF6 ablated the TM antagonism of the DNP-evoked barrier effect; the increase in autophagy evoked by TM was absent in ATF6 KD epithelia. Pharmacological studies indicate that the kinase, DAPK1 is required from the ER stress-ATF6 signal to drive autophagy to kill the internalized E. coli. Conclusion: The ATF6 arm of ER stress antagonizes metabolic stress-induced decreases in epithelial barrier function to commensal bacteria by promoting xenophagy via upregulation of DAPK1. CAG, CIHRAIHS, HPI-NSERC, CNPq

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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