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Enregistrement W2797282777 · doi:10.1016/j.cell.2018.03.057

Tracking Cancer Evolution Reveals Constrained Routes to Metastases: TRACERx Renal

2018· article· en· W2797282777 sur OpenAlexfundno aff
Samra Turajlic, Hang Xu, Kevin Litchfield, Andrew Rowan, Tim Chambers, José I. López, David Nicol, Tim O’Brien, James Larkin, Stuart Horswell, Mark Stares, Lewis Au, Mariam Jamal‐Hanjani, Ben Challacombe, Ashish Chandra, Steve Hazell, Claudia Eichler-Jonsson, Aspasia Soultati, Simon Chowdhury, Sarah Rudman, Joanna Lynch, Archana Fernando, Gordon Stamp, Emma Nye, Faiz Jabbar, Lavinia Spain, Sharanpreet Lall, Rosa Guarch, Mary Falzon, Ian Proctor, Lisa Pickering, Martin Gore, Thomas B.K. Watkins, Sophia Ward, Aengus Stewart, Renzo G. DiNatale, Maria F. Becerra, Ed Reznik, James J. Hsieh, Todd Richmond, George F. Mayhew, Samantha M. Hill, Catherine D. McNally, Carol Jones, Heidi Rosenbaum, Stacey Stanislaw, Daniel L. Burgess, Nelson R. Alexander, Charles Swanton

Notice bibliographique

RevueCell · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal cell carcinoma treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesStand Up To CancerNational Institutes of HealthCRUK Lung Cancer Centre of ExcellenceCancer Research UKNovo Nordisk FondenBreast Cancer Research FoundationRosetrees TrustNational Institute for Health and Care ResearchMinisterio de Economía y CompetitividadWellcome TrustFrancis Crick InstituteNational Cancer InstituteUniversity College LondonInstitute of Cancer ResearchMedical Research CouncilCelgeneRoyal Marsden Cancer Charity
Mots-clésBiologyClear cell renal cell carcinomaMetastasisPhenotypeRenal cell carcinomaPrimary tumorCancer researchTumor progressionPathologyCancerGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clear-cell renal cell carcinoma (ccRCC) exhibits a broad range of metastatic phenotypes that have not been systematically studied to date. Here, we analyzed 575 primary and 335 metastatic biopsies across 100 patients with metastatic ccRCC, including two cases sampledat post-mortem. Metastatic competence was afforded by chromosome complexity, and we identify 9p loss as a highly selected event driving metastasis and ccRCC-related mortality (p = 0.0014). Distinct patterns of metastatic dissemination were observed, including rapid progression to multiple tissue sites seeded by primary tumors of monoclonal structure. By contrast, we observed attenuated progression in cases characterized by high primary tumor heterogeneity, with metastatic competence acquired gradually and initial progression to solitary metastasis. Finally, we observed early divergence of primitive ancestral clones and protracted latency of up to two decades as a feature of pancreatic metastases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations875
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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