Diverse <i>Escherichia coli</i> lineages, from domestic animals and humans in a household, carry colistin resistance gene <i>mcr-1</i> in Ecuador
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The aim of this study was to investigate the presence of Escherichia coli carrying mcr-1 gene in domestic animals close to a child who suffered a peritoneal infection by a mcr-1 positive E. coli . Rectal or cloacal swabs and fecal samples from domestic animals were plated on selective media to isolate colistin-resistant E. coli and isolates were submitted to detection of mcr-1 gene, pulsed field gel electrophoresis (PFGE), multi-locus sequence typing (MLST), replicon typing and S1-PFGE. Four mcr-1 positive E. coli isolates (from chicken, turkey and dog) were recovered. No shared PFGE pattern or MLST sequence type were observed among isolates. A 60Kb IncI1 γ mcr -1-carrying plasmid was detected in all isolates. Our results suggest that mcr-1 gene was horizontally disseminated amongst different lineages of E. coli from domestic animals in the child’s household. Importance Horizontally transferable colistin resistance ( mcr -1 gene) is thought to have originated in domestic animals and transferred to humans through meat and dairy products. In the present report we show evidence that the mcr -1 gene could be transferred to different E. coli strains colonizing different hosts (humans and pets) in the same household.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».