Organization of the multigene families of African Swine Fever Virus
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
African swine fever virus is a complex DNA virus that infects swine and is spread by ticks. Mortality rates in domestic pigs are very high and the virus is a significant threat to pork farming. The genomes of 16 viruses have been sequenced completely, but these represent only a few of the 23 genotypes. The viral genome is unusual in that it contains 5 multigene families, each of which contain 3-19 duplicated copies (paralogs). There is significant sequence divergence between the paralogs in a single virus and between the orthologs in the different viral genomes. This, together with the fact that in most of the multigene families there are numerous gene indels that create truncations and fusions, makes annotation of these regions very difficult; it has led to inconsistent annotation of the 16 viral genomes. In this project, we have created multiple sequence alignments for each of the multigene families and have produced gene maps to help researchers more easily understand the organization of the multigene families among the different viruses. These gene maps will help researchers ascertain which members of the multigene families are present in each of the viruses. This is critical because some of the multigene families are known to be associated with virus virulence.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle