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Enregistrement W2900003524 · doi:10.1093/neuonc/noy148.311

DRES-04. CHARACTERIZATION OF A MODEL OF TEMOZOLOMIDE RESISTANCE IN GLIOBLASTOMA

2018· article· en· W2900003524 sur OpenAlexaff
Elizabeth A. Bering, Alice Yuan, J. G. Cairncross, Michael Blough

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTemozolomideMSH6MLH1MSH2Cancer researchMethyltransferaseDownregulation and upregulationDNA repairHomologous recombinationBiologyDNA mismatch repairO-6-methylguanine-DNA methyltransferaseThiostreptonGlioblastomaGeneGeneticsMethylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite the discovery and widespread use of the chemotherapeutic drug temozolomide (TMZ), glioblastoma (GBM) remains a fatal cancer. TMZ, a DNA alkylating agent, provides a moderate survival benefit to patients whose tumours do not express the O6-methylguanine-methyltransferase (MGMT) gene. However, even these TMZ-sensitive GBMs recur and upon doing so, many are resistant to TMZ. The development of TMZ resistance is commonly associated with mutations in mismatch repair (MMR) and the re-expression of MGMT. Upregulation of homologous recombination (HR) and base excision repair (BER) have also been implicated as mechanisms of acquired TMZ resistance. To better characterize these mechanisms and to develop strategies to prevent or overcome resistance, our laboratory has implemented an in vitro model of inducible resistance in which frequent exposure to TMZ (100µM) yields multiple resistant colonies in the MGMT-methylated GBM cell line U251N (Yip et. al). These colonies displayed varying methods of resistance to TMZ, including those that have been clinically observed in recurrent, TMZ-treated GBMs. Several colonies harboured mutations in MMR genes MSH6, MSH2, and MLH1 with low or absent expression of their respective proteins. In addition, some MMR wild-type colonies had increased expression of poly-ADP ribose (a polymer required for the recognition of DNA breaks by the BER machinery), suggesting that upregulation of BER may be driving resistance. Furthermore, Western Blot analysis revealed that occasional colonies re-expressed MGMT. Interestingly, a few colonies did not possess these alterations, suggesting that their resistance may result from further downstream modifications of MMR or BER, or by mutations in HR. With a more comprehensive characterization of these U251 colonies, we hope to learn more about TMZ resistance in GBM, and refine treatments or preventative therapies for molecularly distinct, TMZ-resistant, recurrent tumours.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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