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Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)

2018· article· en· 790 citations· W2904384071 sur OpenAlex· 10.1038/nbt.4306

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuelles
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Domaine
Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude
Signal candidat: Expérimental (laboratoire)Signal consensuel: aucune
Genre
Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants
0,664
Score d'incertitude au seuil
0,998
Statut de validation
machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants
0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

We present an extension of the Minimum Information about any (x) Sequence (MIxS) standard for reporting sequences of uncultivated virus genomes. Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG) standards were developed within the Genomic Standards Consortium framework and include virus origin, genome quality, genome annotation, taxonomic classification, biogeographic distribution and in silico host prediction. Community-wide adoption of MIUViG standards, which complement the Minimum Information about a Single Amplified Genome (MISAG) and Metagenome-Assembled Genome (MIMAG) standards for uncultivated bacteria and archaea, will improve the reporting of uncultivated virus genomes in public databases. In turn, this should enable more robust comparative studies and a systematic exploration of the global virosphere.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Nature Biotechnology
Thématique
Bacteriophages and microbial interactions
Domaine
Environmental Science
Établissements canadiens
University of British ColumbiaFisheries and Oceans CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnaires
Lawrence Berkeley National LaboratoryU.S. National Library of MedicineNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institutes of HealthKU LeuvenLaboratory Directed Research and DevelopmentNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekBattelleAgence Nationale de la RechercheCenter for Dark Energy Biosphere InvestigationsSight Research UKVanderbilt UniversityNatural Environment Research CouncilEuropean Molecular Biology LaboratoryEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentCairo UniversityU.S. Department of EnergyGordon and Betty Moore FoundationSimons FoundationNational Science Foundation
Mots-clés
GenomeBiologyVirusVirologyComputational biologyGeneticsGene
Résumé présent dans OpenAlex
oui