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Enregistrement W2908525626 · doi:10.1002/cpt.1375

Drug‐Induced Liver Injury due to Flucloxacillin: Relevance of Multiple Human Leukocyte Antigen Alleles

2019· article· en· W2908525626 sur OpenAlexaff
Paola Nicoletti, Guruprasad P. Aithal, Thomas C. Chamberlain, Sally A. Coulthard, Mohammad A. Alshabeeb, Jane I. Grove, Raúl J. Andrade, Einar S. Björnsson, John Dillon, Pär Hallberg, M. Isabel Lucena, Anke H. Maitland‐van der Zee, Jennifer Martin, Mariam Molokhia, Munir Pirmohamed, Mia Wadelius, Yufeng Shen, Matthew R. Nelson, Ann K. Daly

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2019
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueDrug-Induced Hepatotoxicity and Protection
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNIHR Nottingham Biomedical Research CentreEuropean Regional Development FundMedical Research CouncilSvenska LäkaresällskapetUppsala UniversitetRadboud Universitair Medisch CentrumKarolinska InstitutetUniversity of NottinghamKing's College LondonDaiichi-SankyoAbbott LaboratoriesNational Institute for Health and Care ResearchBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome TrustNottingham University Hospitals NHS TrustKing’s College LondonRocheInstituto de Salud Carlos IIIAmgenRadboud UniversiteitNewcastle UniversityNovartisAstraZenecaVetenskapsrådetUniversity of WarwickPfizerMerckDirectorate for Biological SciencesGlaxoSmithKlineSanofiWellcomeUniversiteit Utrecht
Mots-clésFlucloxacillinHuman leukocyte antigenOdds ratioAlleleMedicineImmunologyPenicillinHLA-BGenotypeInternal medicineBiologyAntigenAntibioticsGeneGeneticsStaphylococcus aureus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Some patients prescribed flucloxacillin (~ 0.01%) develop drug‐induced liver injury ( DILI ). HLA ‐B*57:01 is an established genetic risk factor for flucloxacillin DILI . To consolidate this finding, identify additional genetic factors, and assess relevance of risk factors for flucloxacillin DILI in relation to DILI due to other penicillins, we performed a genomewide association study involving 197 flucloxacillin DILI cases and 6,835 controls. We imputed single‐nucleotide polymorphism and human leukocyte antigen (HLA) genotypes. HLA ‐B*57:01 was the major risk factor (allelic odds ratio ( OR ) = 36.62; P = 2.67 × 10 −97 ). HLA ‐B*57:03 also showed an association ( OR = 79.21; P = 1.2 × 10 −6 ). Within the HLA ‐B protein sequence, imputation showed valine 97 , common to HLA ‐B*57:01 and HLA ‐B*57:03, had the largest effect ( OR = 38.1; P = 9.7 × 10 −97 ). We found no HLA ‐B*57 association with DILI due to other isoxazolyl penicillins ( n = 6) or amoxicillin ( n = 15) and no significant non‐ HLA signals for any penicillin‐related DILI .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,222
Tête enseignante GPT0,486
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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