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Enregistrement W2912100687 · doi:10.3201/eid2503.180336

<i>Mycobacterium avium</i> in Community and Household Water, Suburban Philadelphia, Pennsylvania, USA, 2010<i>–</i>2012

2019· article· en· W2912100687 sur OpenAlexaff
Leah Lande, David C. Alexander, Richard J. Wallace, Rebecca Kwait, Elena Iakhiaeva, Myra D. Williams, Andrew D. S. Cameron, Stephen Olshefsky, Ronit Devon, Ravikiran Vasireddy, Donald D. Peterson, Joseph O. Falkinham

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMycobacterium avium complexGenotypingMycobacterium avium-intracellulare infectionGenotypeBiologyMycobacteriumColonizationNontuberculous mycobacteriaMicrobiologyBacteriaGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Attention to environmental sources of Mycobacterium avium complex (MAC) infection is a vital component of disease prevention and control.We investigated MAC colonization of household plumbing in suburban Philadelphia, Pennsylvania, USA.We used variable-number tandemrepeat genotyping and whole-genome sequencing with core genome single-nucleotide variant analysis to compare M. avium from household plumbing biofilms with M. avium isolates from patient respiratory specimens.M. avium was recovered from 30 (81.1%) of 37 households, including 19 (90.5%) of 21 M. avium patient households.For 11 (52.4%) of 21 patients with M. avium disease, isolates recovered from their respiratory and household samples were of the same genotype.Within the same community, 18 (85.7%) of 21 M. avium respiratory isolates genotypically matched household plumbing isolates.Six predominant genotypes were recovered across multiple households and respiratory specimens.M. avium colonizing municipal water and household plumbing may be a substantial source of MAC pulmonary infection.N ontuberculous mycobacteria (NTM) are opportunis- tic human pathogens.Several species of NTM, including members of the Mycobacterium avium complex (MAC), can cause potentially life-threatening pulmonary infections that are difficult to treat (1,2).In 1989, Prince et al. described MAC pulmonary disease in persons without Materials and Methods Study Setting and PopulationLankenau Medical Center is a community-based, academic medical center in Montgomery County, Pennsylvania, Mycobacterium avium in Community and Household Water, Suburban Philadelphia,

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,066

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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