<i>Mycobacterium avium</i> in Community and Household Water, Suburban Philadelphia, Pennsylvania, USA, 2010<i>–</i>2012
Notice bibliographique
Résumé
Attention to environmental sources of Mycobacterium avium complex (MAC) infection is a vital component of disease prevention and control.We investigated MAC colonization of household plumbing in suburban Philadelphia, Pennsylvania, USA.We used variable-number tandemrepeat genotyping and whole-genome sequencing with core genome single-nucleotide variant analysis to compare M. avium from household plumbing biofilms with M. avium isolates from patient respiratory specimens.M. avium was recovered from 30 (81.1%) of 37 households, including 19 (90.5%) of 21 M. avium patient households.For 11 (52.4%) of 21 patients with M. avium disease, isolates recovered from their respiratory and household samples were of the same genotype.Within the same community, 18 (85.7%) of 21 M. avium respiratory isolates genotypically matched household plumbing isolates.Six predominant genotypes were recovered across multiple households and respiratory specimens.M. avium colonizing municipal water and household plumbing may be a substantial source of MAC pulmonary infection.N ontuberculous mycobacteria (NTM) are opportunis- tic human pathogens.Several species of NTM, including members of the Mycobacterium avium complex (MAC), can cause potentially life-threatening pulmonary infections that are difficult to treat (1,2).In 1989, Prince et al. described MAC pulmonary disease in persons without Materials and Methods Study Setting and PopulationLankenau Medical Center is a community-based, academic medical center in Montgomery County, Pennsylvania, Mycobacterium avium in Community and Household Water, Suburban Philadelphia,
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».