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Enregistrement W2939306314 · doi:10.3389/fcimb.2019.00112

Dysbiosis of the Gut Microbiome in Lung Cancer

2019· article· en· W2939306314 sur OpenAlexaff
He Zhuang, Liang Cheng, Yao Wang, Yukun Zhang, Man-Fei Zhao, Gong-Da Liang, Meng‐Chun Zhang, Yongguo Li, Jingbo Zhao, Yina Gao, Yujie Zhou, Shu‐Lin Liu

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular and Infection Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDysbiosisMicrobiomeActinobacteriaBifidobacteriumBiologyGut floraLung cancerPhylumCancerPathogenesisColorectal cancerImmunologyMicrobiologyMedicineInternal medicineBacteria16S ribosomal RNABioinformaticsGeneticsLactobacillus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dear Editor: We wish to submit a manuscript entitled “Dysbiosis of the gut microbiome in lung cancer ” to Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, Microbiome in Health and Disease section, for your consideration to publish as a Research Article. In this study, we examined the gut microbiome between 30 lung cancer patients and 30 healthy controls via next generation sequencing of 16S rDNA to uncover potential biomarkers for early diagnosis and targeted intervention. Previous analyses of the microbe-lung cancer relationship have been focused on lung microbiome. To our knowledge, this is the first study of lung cancer from the perspective of gut microbiome. Our findings support the hypothesis of an lung cancer-specific compositional structure of gut bacterial populations. Our work suggests that the dysbiosis of the gut microbiome in lung cancer as reflected by reduced abundance of Actinobacteria and Bifidobacterium and elevated levels of Enterococcus had facilitated the development of lung cancer and may help develop novel strategies for early prevention and targeted intervention against lung cancer. The authors claim that none of the materials in the paper has been published or is under consideration for publication elsewhere. Thank you very much for your consideration and we look forward to hearing from you soon. Yours Sincerely He Zhuang and Shu-Lin Liu Genomics Research Center Harbin Medical University 157 Baojian Road Harbin, 150081 China

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0080,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations244
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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