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Enregistrement W2952504636 · doi:10.1128/mbio.01861-17

The Complex Quorum Sensing Circuitry of <i>Burkholderia thailandensis</i> Is Both Hierarchically and Homeostatically Organized

2017· article· en· W2952504636 sur OpenAlexafffund
Servane Le Guillouzer, Marie‐Christine Groleau, Éric Déziel

Notice bibliographique

RevuemBio · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésQuorum sensingHomoserineBurkholderiaBiologyGeneTranscription (linguistics)BacteriaGeneticsCell biologyChemistryMicrobiologyVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The genome of the bacterium Burkholderia thailandensis encodes three complete LuxI/LuxR-type quorum sensing (QS) systems: BtaI1/BtaR1 (QS-1), BtaI2/BtaR2 (QS-2), and BtaI3/BtaR3 (QS-3). The LuxR-type transcriptional regulators BtaR1, BtaR2, and BtaR3 modulate the expression of target genes in association with various N -acyl- l -homoserine lactones (AHLs) as signaling molecules produced by the LuxI-type synthases BtaI1, BtaI2, and BtaI3. We have systematically dissected the complex QS circuitry of B. thailandensis strain E264. Direct quantification of N -octanoyl-homoserine lactone (C 8 -HSL), N -3-hydroxy-decanoyl-homoserine lactone (3OHC 10 -HSL), and N -3-hydroxy-octanoyl-homoserine lactone (3OHC 8 -HSL), the primary AHLs produced by this bacterium, was performed by liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) in the wild-type strain and in QS deletion mutants. This was compared to the transcription of btaI1 , btaI2 , and btaI3 using chromosomal mini-CTX- lux transcriptional reporters. Furthermore, the levels of expression of btaR1 , btaR2 , and btaR3 were monitored by quantitative reverse transcription-PCR (qRT-PCR). We observed that C 8 -HSL, 3OHC 10 -HSL, and 3OHC 8 -HSL are differentially produced over time during bacterial growth and correlate with the btaI1 , btaI2 , and btaI3 gene expression profiles, revealing a successive activation of the corresponding QS systems. Moreover, the transcription of the btaR1 , btaR2 , and btaR3 genes is modulated by cognate and noncognate AHLs, showing that their regulation depends on themselves and on other QS systems. We conclude that the three QS systems in B. thailandensis are interdependent, suggesting that they cooperate dynamically and function in a concerted manner in modulating the expression of QS target genes through a successive regulatory network. IMPORTANCE Quorum sensing (QS) is a widespread bacterial communication system coordinating the expression of specific genes in a cell density-dependent manner and allowing bacteria to synchronize their activities and to function as multicellular communities. QS plays a crucial role in bacterial pathogenicity by regulating the expression of a wide spectrum of virulence/survival factors and is essential to environmental adaptation. The results presented here demonstrate that the multiple QS systems coexisting in the bacterium Burkholderia thailandensis , which is considered the avirulent version of the human pathogen Burkholderia pseudomallei and thus commonly used as an alternative study model, are hierarchically and homeostatically organized. We found these QS systems to be finely integrated into a complex regulatory network, including transcriptional and posttranscriptional interactions, and further incorporating growth stages and temporal expression. These results provide a unique, comprehensive illustration of a sophisticated QS network and will contribute to a better comprehension of the regulatory mechanisms that can be involved in the expression of QS-controlled genes, in particular those associated with the establishment of host-pathogen interactions and acclimatization to the environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,474

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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