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Enregistrement W2955588652

Synthetic analogs of the marine natural product hemiasterlin: Optimization and discovery of E7974, a novel and potent antitumor agent

2005· article· en· W2955588652 sur OpenAlexaboutno aff
James J. Kowalczyk, Shawn Schiller, Mark R. Spyvee, Yang Hu, Boris M. Seletsky, Christina J. Shaffer, Veronique Marceau, Ye Yao, Galina Kuznetsov, Karen TenDyke, Diana Liu, Cheryl A. Rowell, Bruce A. Littlefield, Edward M. Suh

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMarine Sponges and Natural Products
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryStereochemistryQuantitative structure–activity relationshipNatural productTopoisomeraseSteric effectsCombinatorial chemistryDNABiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

1213 A series of 13 anthrapyrazole (AP) compounds that were analogs of piroxantrone and losoxantrone were synthesized. Three-dimensional quantitative structure-activity analyses (3D-QSAR) were carried out on the AP compounds using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity index analysis (CoMSIA) in order to determine the factors affecting the cell growth inhibitory (CHO, DZR, K562 and K/VP.5 cells), DNA binding (ΔTm) and inhibition of DNA topoisomerase II decatenation catalytic activity. Conformational analysis of all analogs was first performed with the CONFORT module implemented in SYBYL to identify the global minimum energy conformation. The most active compound, AP10, was then used as the template molecule. Steric and electrostatic fields were determined in CoMFA and three additional fields (hydrophobic, hydrogen donor and hydrogen acceptor) were determined in CoMSIA. Both CoMFA and CoMSIA analysis of the biological properties yielded statistically significant models upon partial least squares analysis. The information obtained from CoMFA and CoMSIA 3D-contour maps is to be used to predict the activity of new anthrapyrazoles with increased activity. Support: CIHR and a Canada Research Chair in Drug Development

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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