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Enregistrement W2959335923 · doi:10.1212/nxg.0000000000000348

Genetic risk of Parkinson disease and progression:

2019· article· en· W2959335923 sur OpenAlexfundno aff
Hirotaka Iwaki, Cornelis Blauwendraat, Hampton L. Leonard, Ganqiang Liu, Jodi Maple‐Grødem, Jean‐Christophe Corvol, Lasse Pihlstrøm, Marlies van Nimwegen, Samantha J. Hutten, Khanh‐Dung H. Nguyen, Jacqueline Rick, Shirley Eberly, Faraz Faghri, Peggy Auinger, Kirsten M. Scott, Ruwani Wijeyekoon, Vivianna M. Van Deerlin, Dena Hernández, Aaron Day-Williams, Alexis Brice, Guido Alves, Alastair J. Noyce, Ole‐Bjørn Tysnes, Jonathan Evans, David P. Breen, Karol Estrada, Claire Wegel, Fabrice Danjou, David K. Simon, Bernard Ravina, Mathias Toft, Peter Heutink, Bastiaan R. Bloem, Daniel Weintraub, Roger A. Barker, Caroline H. Williams‐Gray, Bart P. van de Warrenburg, Jacobus J. van Hilten, Clemens R. Scherzer, Andrew Singleton, Mike A. Nalls

Notice bibliographique

RevueNeurology Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Human Genome Research InstituteNational Institute on AgingNIHR Cambridge Biomedical Research CentreHelse Sør-Øst RHFMedical Research CouncilParkinsonfondenAllerganNational Institutes of HealthVoyager TherapeuticsNational Institute for Health and Care ResearchAgence Nationale de Sécurité du Médicament et des Produits de SantéCentre National de la Recherche ScientifiqueEvelyn TrustIpsenFonds Wetenschappelijk OnderzoekAssociation France ParkinsonAssistance Publique - Hôpitaux de ParisInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleBiogenAgence Nationale de la RechercheH. Lundbeck A/SRosetrees TrustParkinson's UKRadboud UniversiteitHersenstichtingVerily Life SciencesGlaxoSmithKlineBarts CharityJohns Hopkins UniversityAmarin CorporationMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchParkinson's FoundationKinetics FoundationWellcome TrustZonMwBritannia PharmaceuticalsWeston Brain InstituteNational Institute of Neurological Disorders and StrokeSunovionNorges ForskningsrådUniversity of VirginiaNational Parkinson FoundationEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchPfizerUniversity of RochesterUniversity of PennsylvaniaBrown UniversityCHDI FoundationMassachusetts General HospitalSmart Family FoundationParkinson's Disease FoundationU.S. Department of DefenseOhio State UniversityHarvard NeuroDiscovery CenterParkinson VerenigingNasjonalforeningen for FolkehelsenUniversity of Michigan
Mots-clésAlleleOdds ratioHazard ratioLRRK2GenotypeInternal medicineDiseaseGeneticsMedicineBiologyParkinson's diseaseConfidence intervalGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective To determine if any association between previously identified alleles that confer risk for Parkinson disease and variables measuring disease progression. Methods We evaluated the association between 31 risk variants and variables measuring disease progression. A total of 23,423 visits by 4,307 patients of European ancestry from 13 longitudinal cohorts in Europe, North America, and Australia were analyzed. Results We confirmed the importance of GBA on phenotypes. GBA variants were associated with the development of daytime sleepiness (p.N370S: hazard ratio [HR] 3.28 [1.69–6.34]) and possible REM sleep behavior (p.T408M: odds ratio 6.48 [2.04–20.60]). We also replicated previously reported associations of GBA variants with motor/cognitive declines. The other genotype-phenotype associations include an intergenic variant near LRRK2 and the faster development of motor symptom (Hoehn and Yahr scale 3.0 HR 1.33 [1.16–1.52] for the C allele of rs76904798) and an intronic variant in PMVK and the development of wearing-off effects (HR 1.66 [1.19–2.31] for the C allele of rs114138760). Age at onset was associated with TMEM175 variant p.M393T (−0.72 [−1.21 to −0.23] in years), the C allele of rs199347 (intronic region of GPNMB, 0.70 [0.27–1.14]), and G allele of rs1106180 (intronic region of CCDC62, 0.62 [0.21–1.03]). Conclusions This study provides evidence that alleles associated with Parkinson disease risk, in particular GBA variants, also contribute to the heterogeneity of multiple motor and nonmotor aspects. Accounting for genetic variability will be a useful factor in understanding disease course and in minimizing heterogeneity in clinical trials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations162
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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