A Candidate Regulatory Variant at the TREM Gene Cluster Confer Alzheimer’s Disease Risk by Modulating Both Amyloid-β Pathology and Neuronal Degeneration
Notice bibliographique
Résumé
Background: Rs9357347 located at the triggering receptor expressed on myeloid cells (TREM) gene cluster could increase TREM2 and TREM-like transcript 1 (TREML1) brain gene expression, which is considered to play a protective role against Alzheimer’s disease (AD). Objectives: To investigate the role of rs9357347 in AD pathogenesis by exploring the effects of rs9357347 on AD specific biomarkers. Methods: This study analyzed the association of rs9357347 with AD-related cerebrospinal fluid (CSF) and neuroimaging markers from 201 cognitively normal (CN) older adults, 349 elders with mild cognitive impairment (MCI), and 172 elders with AD dementia from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). We next analyzed the association in 259 amyloid-β positive (Aβ+) elders and 117 amyloid-β negative (Aβ-) elders (Aβ+: CSF Aβ1-42 ≤ 192pg/ml; Aβ-: CSF Aβ1-42 > 192pg/ml). Associations were tested using multiple linear regression models at baseline. Furthermore, multiple mixed-effects models were used in a longitudinal study which lasted 4 years. Results: At baseline, we found that rs9357347 had association with CSF Aβ1-42 in CN group (β = 0.357, P=0.009). In AD group, rs9357347 was associated with total tau (T-tau) level (β = -0.436, P = 0.007). Moreover, the strong influence exerted by rs9357347 on T-tau was also seen in Aβ+ group (β = -0.202, P = 0.036). In the longitudinal study, rs9357347 was also found to be associated with Aβ1-42 in CN group (β = 0.329, P= 0.023). In AD group, the mutation of rs9357347 was associated with slower accumulation of T-tau (β = -0.472, P = 0.002) and tau phosphorylated at threonine 181 (P-tau 181 [β = -0.330, P = 0.019]). Furthermore, the obvious influence exerted by rs9357347 on T-tau was also seen in Aβ+ group (β = -0.241, P = 0.013). Conclusion: This study suggested that rs9357347 reduced the risk of AD by modulating both amyloid-β pathology and neuronal degeneration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».