MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2966901273 · doi:10.1074/jbc.ra119.009910

Ega3 from the fungal pathogen Aspergillus fumigatus is an endo-α-1,4-galactosaminidase that disrupts microbial biofilms

2019· article· en· W2966901273 sur OpenAlexafffund
Natalie C. Bamford, François Le Mauff, Adithya S. Subramanian, Patrick Yip, Claudia Millán, Yongzhen Zhang, Caitlin Zacharias, Adam Forman, Mark Nitz, Jeroen D. C. Codée, Isabel Usón, Donald C. Sheppard, P. Lynne Howell

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreInstitute of Infection and ImmunityHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéWestern Economic Diversification CanadaCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthUniversity of SaskatchewanHospital for Sick ChildrenNational Institute of General Medical SciencesMinisterio de Ciencia e InnovaciónUniversity of TorontoCystic Fibrosis CanadaMcGill UniversityMcGill University Health CentreBiological and Environmental ResearchGovernment of OntarioU.S. Department of EnergyNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Light Source
Mots-clésAspergillus fumigatusBiofilmMicrobiologyFungal pathogenPathogenAspergillusPathogenic organismBiologyChemistryBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

docking studies also uncovered the molecular determinants for galactosamine specificity and substrate binding at the -2 to +1 binding subsites. The findings in this study increase the structural and mechanistic understanding of the GH114 family, which has >600 members encoded by plant and opportunistic human pathogens, as well as in industrially used bacteria and fungi.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCarbohydrate Chemistry and SynthesisTravaux en français237 207