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Enregistrement W2968251716 · doi:10.1101/lm.049965.119

Polysomes identified by live imaging of nascent peptides are stalled in hippocampal and cortical neurites

2019· article· en· W2968251716 sur OpenAlexafffund
Jesse J. Langille, Keren Ginzberg, Wayne S. Sossin

Notice bibliographique

RevueLearning & Memory · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
Mots-clésPolysomePuromycinCell biologyNeuriteTranslation (biology)Hippocampal formationMessenger RNAProtein biosynthesisRNABiologyRibosomeChemistryBiophysicsMolecular biologyBiochemistryNeuroscienceGeneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In neurons, mRNAs can be repressed postinitiation and assembled into granules enabling the transport and later, regulated reactivation of the paused mRNAs. It has been suggested that a large percentage of transcripts in neuronal processes are stored in these stalled polysomes. Given this, it is predicted that nascent peptides should be abundant in these granules. Nascent peptides can be visualized in real time by the SunTag system. Using this system, we observe nascent peptides in neuronal processes that are resistant to runoff with the initiation inhibitor homoharringtonin (HHT) and to release by puromycin, properties expected from RNA granules consisting of stalled polysomes. In contrast, nascent peptides in nonneuronal cells and neuronal cell bodies were not resistant to HHT or puromycin. Stalled polysomes can also be visualized after runoff with ribopuromycylation and the RNA granules imaged with ribopuromycylation were the same as those with SunTag visualized nascent peptides. Accordingly, the ribopuromycylated puncta in neuronal dendrites were also resistant to puromycin. Thus, the SunTag technique corroborates in situ evidence of stalled polysomes and will allow for the live examination of these translational structures as a mechanism for mRNA transport and regulated protein synthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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