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Enregistrement W2987551746 · doi:10.1093/ofid/ofz476

Clinical Outcomes Associated With Escherichia coli Infections in Adults With Cystic Fibrosis: A Cohort Study

2019· article· en· W2987551746 sur OpenAlexafffundabout
Brett Edwards, Ranjani Somayaji, Jasper Wong, Conrad Izydorczyk, Barbara J. Waddell, Douglas G. Storey, Harvey Rabin, Michael G. Surette, Michael D. Parkins

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCystic Fibrosis CanadaGilead Sciences
Mots-clésMedicineCystic fibrosisCohortEscherichia coliPathogenic organismCohort studyInternal medicineMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Analysis of “emerging” pathogens in cystic fibrosis (CF) lung disease has focused on unique pathogens that are rare in other human diseases or are drug resistant. Escherichia coli is recovered in the sputum of up to 25% of patients with CF, yet little is known about the epidemiology or clinical impact of infection. Methods We studied patients attending a Canadian adult CF clinic who had positive sputum cultures for E coli from 1978 to 2016. Infection was categorized as transient or persistent (≥3 positive sputum cultures, spanning >6 months). Those with persistent infection were matched 2:1 with age, sex, and time-period controls without history of E coli infection, and mixed-effects models were used to assess pulmonary exacerbation (PEx) frequency, lung function decline, hospitalization, and intravenous antibiotic days. Results Forty-five patients (12.3%) had E coli recovered from sputum samples between 1978 and 2016, and 18 patients (40%) developed persistent infection. Nine patients (24%) had PEx at incident infection, and increased bioburden was predictive of exacerbation (P = .03). Risk factors for persistent infection included lower nutritional status (P < .001) and lower lung function (P = .009), but chronic infection with Pseudomonas aeruginosa was protective. There was no difference in annual lung function decline, need for hospitalization or intravenous antibiotics, or risk of PEx in patients with persistent infection. Conclusions Persistent E coli infection was frequent and was more common in CF patients with low nutritional status and lung function. However, this does not predict clinical decline. Multicenter studies would allow better characterization of the epidemiology and clinical impact of E coli infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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