MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2989843386

HIV infection is associated with preservation of MAIT cells in the lungs but alteration of their phenotype and T cell receptor repertoire

2016· article· en· W2989843386 sur OpenAlexaff
Emily Wong, Bongiwe Z. Xulu, Sanjay M. Prakadan, Alex K. Shalek, Umesh Lalloo, Prinita Baijnath, Moosa Suleman, V. Moodley, M Mitha, Priya Maharaj, Cecilia T. Costiniuk, Morten Nielsen, Zoey Mhlane, Farina Karim, David Lewinsohn, Thumbi Ndung’u

Notice bibliographique

RevueTechnical University of Denmark, DTU Orbit (Technical University of Denmark, DTU) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenotypeMedicineRepertoireHuman immunodeficiency virus (HIV)ImmunologyReceptorCellVirologyBiologyGeneticsGeneInternal medicine
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: High dietary fats were reported to induce intestinal dysbiosis, drive gut inflammation and breakdown the intestinal epithelial barrier, granting intestinal flora access to the bloodstream.As microbial translocation is a major determinant of the chronic immune activation and HIV/SIV disease progression, we investigated whether fat diet impacts HIV/SIV pathogenesis.Methods: The nonprogressive African green monkey (AGM) model of SIV is an ideal system to assess the role of fat diet on disease progression, because they do not develop SIV-related intestinal dysfunction.We included 4 AGMs that received a fat diet prior and after SIVsab infection, and 5 controls in which the impact on key parameters of SIV infection such as: viral loads, CD4 + T cell counts, microbial translocation, immune activation and inflammation were compared and contrasted.Results: LPS levels increased in the AGMs receiving fat diet prior and after SIV infection.Fat-rich diet also resulted in increases of immune activation (HLA-DR CD38, CD69 and Ki-67) and inflammation (inflammatory cytokines-IL-6, IL-17 and C reactive protein), leading to a prolonged depletion of CD4 + T cells compared to controls.However, these significant alterations of key parameters that are associated with the lack of disease progression in natural hosts of SIVs did not reach the levels described during progressive HIV/SIV infection.Furthermore, these changes did not result in significant increases in the levels of viral replication in the AGMs receiving a fat diet.Conclusions: Administration of fat-rich diet resulted in alterations of markers of pathogenicity in the nonprogressive SIV infection of AGMs.Although not major, these changes were significant, suggesting that a diet very rich in fats may negatively impact HIV pathogenesis, especially if combined with other behavioral risk factors reported to impact gut integrity or systemic inflammation, such as alcohol consumption, drug usage and smoking.Detailed studies on the correlations between fat diet, alterations in the intestinal microbiota, metabolic markers, liver function and SIV progression to AIDS are in progress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTechnical University of Denmark, DTU Orbit (Technical University of Denmark, DTU)Même sujetImmune Cell Function and InteractionTravaux en français237 207