MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3004901913 · doi:10.1371/journal.pbio.3000597

Selective sweeps on novel and introgressed variation shape mimicry loci in a butterfly adaptive radiation

2020· article· en· W3004901913 sur OpenAlexaff
Markus Moest, Steven M. Van Belleghem, Jennifer James, Camilo Salazar, Simon H. Martin, Sarah L. Barker, Gilson R. P. Moreira, Claire Mérot, Mathieu Joron, Nicola J. Nadeau, Florian M. Steiner, Chris D. Jiggins

Notice bibliographique

RevuePLoS Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesFP7 Ideas: European Research CouncilScience and Technology Facilities CouncilExploratory Research for Advanced TechnologyNatural Environment Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilMedical Research CouncilDirectorate for Biological SciencesDell EMCUniversidad del RosarioIsaac Newton TrustSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilAustrian Science FundCHIST-ERAAgence Nationale de la RechercheNational Science FoundationUniversity of CambridgeSight Research UKConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación (COLCIENCIAS)
Mots-clésBiologyMimicryButterflyEvolutionary biologyGeneticsAdaptation (eye)Variation (astronomy)Genetic variationAdaptive radiationComputational biologyZoologyGenePhylogeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural selection leaves distinct signatures in the genome that can reveal the targets and history of adaptive evolution. By analysing high-coverage genome sequence data from 4 major colour pattern loci sampled from nearly 600 individuals in 53 populations, we show pervasive selection on wing patterns in the Heliconius adaptive radiation. The strongest signatures correspond to loci with the greatest phenotypic effects, consistent with visual selection by predators, and are found in colour patterns with geographically restricted distributions. These recent sweeps are similar between co-mimics and indicate colour pattern turn-over events despite strong stabilising selection. Using simulations, we compare sweep signatures expected under classic hard sweeps with those resulting from adaptive introgression, an important aspect of mimicry evolution in Heliconius butterflies. Simulated recipient populations show a distinct 'volcano' pattern with peaks of increased genetic diversity around the selected target, characteristic of sweeps of introgressed variation and consistent with diversity patterns found in some populations. Our genomic data reveal a surprisingly dynamic history of colour pattern selection and co-evolution in this adaptive radiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,631
Score d'incertitude au seuil0,425

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations87
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS BiologyMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207