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Enregistrement W3009078156 · doi:10.1073/pnas.1916965117

Intestinal bile acids directly modulate the structure and function of <i>C. difficile</i> TcdB toxin

2020· article· en· W3009078156 sur OpenAlexafffund
John Tam, Simoun Icho, Evelyn Utama, Kathleen E. Orrell, Rodolfo F. Gómez‐Biagi, Casey M. Theriot, Heather K. Kroh, Stacey A. Rutherford, D. Borden Lacy, Roman A. Melnyk

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical SciencesGovernment of CanadaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésBile acidToxinOligopeptideClostridium difficile toxin AChemistryAmino acidReceptorBiochemistryBiologyPeptideClostridium difficile

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Clostridioides difficile is a bacterial pathogen of global importance that is a major cause of hospital-acquired diarrhea. Antibiotic-mediated disruptions to the gut microbiota and associated metabolome promote C. difficile growth and infection through mechanisms that are poorly understood. Here, we show that intestinal bile acids, which are known to play a role in C. difficile germination and outgrowth, also directly bind and inhibit TcdB toxin, the primary virulence determinant of C. difficile . Bile acid binding induces a major conformational change in TcdB structure that prevents receptor binding and uptake into cells. In addition to suggesting a role for bile acids in protecting against C. difficile pathogenesis, these findings highlight an approach to block C. difficile virulence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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