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Enregistrement W3011033328 · doi:10.1101/2020.03.19.20031138

Adiposity, metabolites, and colorectal cancer risk: Mendelian randomization study

2020· preprint· en· W3011033328 sur OpenAlexafffund
Caroline J. Bull, Joshua A. Bell, Neil Murphy, Eleanor Sanderson, George Davey Smith, Nicholas J. Timpson, Barbara L. Banbury, Demetrius Albanes, Sonja I. Berndt, Stéphane Bezieau, D. Timothy Bishop, Hermann Brenner, Daniel D. Buchanan, Andrea N. Burnett‐Hartman, Graham Casey, Sergi Castellvı́-Bel, Andrew T. Chan, Jenny Chang‐Claude, Amanda J. Cross, Albert de la Chapelle, Jane C. Figueiredo, Steven Gallinger, Sue M. Gapstur, Graham G. Giles, Stephen B. Gruber, Andrea Gsur, Jochen Hampe, Heather Hampel, Tabitha A. Harrison, Michael Hoffmeister, Li Hsu, Wen‐Yi Huang, Jeroen R. Huyghe, Mark A. Jenkins, Corinne E. Joshu, Temitope O. Keku, Tilman Kühn, Sun‐Seog Kweon, Loı̈c Le Marchand, Christopher I. Li, Li Li, Annika Lindblom, Vicente Martín, Anne M. May, Roger L. Milne, Vı́ctor Moreno, Polly A. Newcomb, Kenneth Offit, Shuji Ogino, Amanda I. Phipps, Elizabeth A. Platz, John D. Potter, Conghui Qu, J. Ramón Quirós, Gad Rennert, Elio Ríboli, Lori C. Sakoda, Clemens Schafmayer, Robert E. Schoen, Martha L. Slattery, Catherine M. Tangen, Cornelia M. Ulrich, Fränzel JB van Duijnhoven, Bethany Van Guelpen, Kala Visvanathan, Pavel Vodička, Ludmila Vodičková, Hansong Wang, Emily White, Alicja Wolk, Michael O. Woods, Anna H. Wu, Peter T. Campbell, Wei Zheng, Ulrike Peters, Emma E. Vincent, Marc J. Gunter

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesMedicinska fakulteten, Umeå UniversitetInstituto de Salud Carlos IIICancer Council VictoriaOntario Ministry of Research and InnovationNational Health and Medical Research CouncilWorld Cancer Research FundMedical Research CouncilCenters for Disease Control and PreventionChonnam National University Hwasun HospitalHellenic Health FoundationJunta de Castilla y LeónXunta de GaliciaMutuelle Générale de l'Education NationaleElizabeth Blackwell Institute for Health Research, University of BristolDeutsche KrebshilfeAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroNordForskVetenskapsrådetNational Cancer InstituteFundación Científica Asociación Española Contra el CáncerMinisterio de Economía y CompetitividadBundesministerium für Bildung und ForschungUniversity of CambridgeZonMwCanadian Cancer Society Research InstituteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleDamon Runyon Cancer Research FoundationUniversity of BristolChonnam National UniversityCentres de Recerca de CatalunyaUmeå UniversitetMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyGroupement des Entreprises Françaises dans la lutte contre le CancerCentre Hospitalier Universitaire de NantesEuropean CommissionCancerfondenCanadian Institutes of Health ResearchDiabetes UKGeneralitat de CatalunyaFood Standards AgencyKempe FoundationConseil Régional des Pays de la LoireMatthias Lackas-StiftungGénome QuébecKWF KankerbestrijdingWageningen University and ResearchCancer Research UKXarxa de Bancs de Tumors de CatalunyaWorld Health OrganizationMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterWellcome TrustInstitut Gustave-RoussyGrantová Agentura České RepublikyJohns Hopkins UniversityCentre International de Recherche sur le CancerLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaNational Institute for Health and Care ResearchDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteCancer Research Foundation in Northern SwedenHarvard T.H. Chan School of Public HealthFlorida Department of HealthNational Institutes of HealthMike and Josie Harper Cancer Research InstituteUniversity of PittsburghWorld Cancer Research Fund InternationalAssociation Anne de Bretagne GenetiqueMcGill UniversityMoffitt Cancer CenterPelotoniaWereld Kanker Onderzoek FondsBrigham and Women's HospitalAmerican Cancer SocietyUniversity of South FloridaU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésMendelian randomizationMedicineColorectal cancerBody mass indexOdds ratioInternal medicineOncologyConfidence intervalObesityCancerWaist–hip ratioWaistEndocrinologyGeneticsBiologyGenotypeGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Importance Evidence on adiposity altering colorectal cancer (CRC) risk differently among men and women, and on metabolic alterations mediating effects of adiposity on CRC, is unclear. Objective To examine sex- and site-specific associations of adiposity with CRC risk, and whether adiposity-associated metabolites explain associations of adiposity with CRC. Design Two-sample Mendelian randomization (MR) study. Setting Genetic variants from expanded genome-wide association studies of body mass index (BMI) and waist-to-hip ratio (WHR, unadjusted for BMI; N=806,810), and 123 metabolites (mostly lipoprotein subclass-specific lipids) from targeted nuclear magnetic resonance metabolomics (N=24,925), were used as instruments. Sex-combined and sex-specific MR was conducted for BMI and WHR with CRC risk; sex-combined MR was conducted for BMI and WHR with metabolites, for metabolites with CRC, and for BMI and WHR with CRC adjusted for metabolite classes. Participants 58,221 cases and 67,694 controls (Genetics and Epidemiology of Colorectal Cancer Consortium; Colorectal Cancer Transdisciplinary Study; Colon Cancer Family Registry). Main outcome measures Incident CRC (overall and site-specific). Results Among men, higher BMI (per 4.2 kg/m 2 ) was associated with 1.23 (95%-confidence interval (CI)=1.08, 1.38) times higher CRC odds (inverse-variance-weighted (IVW) model); among women, higher BMI (per 5.2 kg/m 2 ) was associated with 1.09 (95%-CI=0.97, 1.22) times higher CRC odds. Higher WHR was more strongly associated with CRC risk among women (IVW-OR=1.25, 95%-CI=1.08, 1.43 per 0.07-ratio) than men (IVW-OR=1.05, 95%-CI=0.81, 1.36 per 0.07-ratio). BMI or WHR was associated with 104 metabolites (false-discovery-rate-corrected P≤0.05) including low-density lipoprotein (LDL) cholesterol, but these metabolites were generally unassociated with CRC in directions consistent with mediation of adiposity-CRC relations. In multivariable MR, associations of BMI and WHR with CRC were not attenuated following adjustment for representative metabolite classes – e.g. the univariable IVW-OR of BMI for CRC was 1.12 (95%-CI=1.00, 1.26), and 1.11 (95%-CI=0.99, 1.26) adjusting for LDL lipids. Conclusions and relevance Our results suggest that higher BMI more greatly raises CRC risk among men, whereas higher WHR more greatly raises CRC risk among women. Adiposity was associated with numerous metabolic alterations, but none of these alterations explained associations between adiposity and CRC. More detailed metabolomic measures are likely needed to clarify mechanistic pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,035
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,091

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,035
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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