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Enregistrement W3016420530 · doi:10.1101/2020.04.17.047217

Discovery of <i>Plasmodium falciparum</i> SR12 as a GOLD-Domain seven transmembrane protein regulating GPCR trafficking in mammalian cells

2020· preprint· en· W3016420530 sur OpenAlexafffund
Pedro Henrique Scarpelli Pereira, Camila L. Kiyan, Miriam S. Moraes, Michel Bouvier, Célia R. S. Garcia

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesAlliance de recherche numérique du CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésThrombinG protein-coupled receptorReceptorHEK 293 cellsCell biologyThrombin receptorBiologyPlasmodium falciparumMuscarinic acetylcholine receptorUrokinase receptorSignal transductionChemistryBiochemistryPlateletMalariaImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Considered a significant public health issue, the growing resistance to conventional antimalarials necessitates the identification of new targets for drug development. Given that G protein-coupled receptors (GPCRs) are readily druggable targets, we explored the cellular role and potential structure of a GPCR-like protein identified in the P. falciparum genome, serpentine receptor 12 (SR12). Alphafold structure analysis, coupled with molecular dynamics simulations of SR12, revealed structural similarities to the Golgi dynamics domain (GOLD)-seven-transmembrane helix protein family (GOST proteins). This family of proteins, which includes TMEM87A and the orphan GPCRs GPR180, GPR107, and GPR108, is involved in subcellular trafficking. Consistent with such a trafficking role, SR12 is mainly present in the secretory pathway when expressed in mammalian cells. Co-expression of SR12 with GPCRs PAR1 and M3R led to increased plasma membrane targeting of these receptors. SR12 expression in HEK293 cells conferred Gαq-dependent calcium signaling in response to the protease activated receptor 1 (PAR1) agonist thrombin. This response was completely abrogated in cells genetically devoid of PARs (PAR KO cells), consistent with its functions as a chaperone-like protein, promoting receptor trafficking to the plasma membrane. Taken together, the data show that the Plasmodium falciparum SR12 promotes GPCR trafficking when expressed in mammalian cells. Although the physiological consequences of such activity remain to be determined, the finding revealed the presence of a GOST protein in the parasite genome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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