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Enregistrement W3019822976 · doi:10.1016/j.celrep.2020.107522

Cathepsin S Alterations Induce a Tumor-Promoting Immune Microenvironment in Follicular Lymphoma

2020· article· en· W3019822976 sur OpenAlexaff
Deepak Bararia, Johannes Adrian Hildebrand, Sebastian Stolz, Sarah Haebe, Stefan Alig, Christopher Trevisani, Francisco Osorio‐Barrios, Michael D. Bartoschek, Michael Mentz, Alessandro Pastore, Erik Gaitzsch, Michael Heide, Vindi Jurinović, Katharina Rautter, Jay Gunawardana, Muhammed B. Sabdia, Monika Szczepanowski, Julia Richter, Wolfgang Hiddemann, Abner Louissaint, Christina Ludwig, Sebastian Bultmann, Heinrich Leonhardt, Sebastian Eustermann, Karl‐Peter Hopfner, Michael von Bergwelt‐Baildon, Christian Steidl, Robert Kridel, Joshua W.D. Tobin, Maher K. Gandhi, David M. Weinstock, Marc Schmidt‐Supprian, Menyhárt B. Sárosi, Martina Rudelius, Verena Passerini, Josef Mautner, Oliver Weigert

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensSpinal Cord Injury BC
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Hematology AssociationDeutsche KrebshilfeBMC Software
Mots-clésFollicular lymphomaTumor microenvironmentImmune systemLymphomaCancer researchImmunologyCathepsinFollicular phaseBiologyMedicineEnzymeInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tumor cells orchestrate their microenvironment. Here, we provide biochemical, structural, functional, and clinical evidence that Cathepsin S ( CTSS ) alterations induce a tumor-promoting immune microenvironment in follicular lymphoma (FL). We found CTSS mutations at Y132 in 6% of FL (19/305). Another 13% (37/286) had CTSS amplification, which was associated with higher CTSS expression. CTSS Y132 mutations lead to accelerated autocatalytic conversion from an enzymatically inactive profrom to active CTSS and increased substrate cleavage, including CD74, which regulates major histocompatibility complex class II (MHC class II)-restricted antigen presentation. Lymphoma cells with hyperactive CTSS more efficiently activated antigen-specific CD4 + T cells in vitro . Tumors with hyperactive CTSS showed increased CD4 + T cell infiltration and proinflammatory cytokine perturbation in a mouse model and in human FLs. In mice, this CTSS-induced immune microenvironment promoted tumor growth. Clinically, patients with CTSS-hyperactive FL had better treatment outcomes with standard immunochemotherapies, indicating that these immunosuppressive regimens target both the lymphoma cells and the tumor-promoting immune microenvironment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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