Secondary Metabolite Biosynthesis during Vegetative Incompatibility in Cryphonectria parasitica, Causal Agent of the American Chestnut Blight
Notice bibliographique
Résumé
Vegetative Incompatibility (VI) can occur when filamentous fungi fuse during the asexual (mitotic) growth phase. In Cryphonectria parasitica, VI is modulated by six vic loci; hyphal fusion between strains that differ at one or more vic loci results in cell death. VI is considered an immune-like response that restricts heterokaryon formation and transmission of deleterious cytoplasmic elements through unknown mechanisms. A transcriptomic analysis of vic3associated incompatibility identified a set of differentially expressed genes within biosynthetic gene clusters (BGCs). Using UPLC-HRMS, we detected significant shifts in secondary metabolite production during vic3 incompatibility. Among these metabolites, HPLC purification and NMR structure elucidation revealed that a new variant of calbistrin is linked to VIupregulated BGCs, as is a farnesyl-S-oxide analog resembling mating pheromones. Similarly, detection of putative lysophosphatidylcholines and other modified lipids implicates membrane alteration during VI. Together, these findings suggest VI involves synthesis of novel secondary metabolites and complex membrane-associated signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».