MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3034021106 · doi:10.1016/j.scr.2020.101856

Generation of two patient-derived iPSC lines from siblings (LIBUCi001-A and LIBUCi002-A) and a genetically modified iPSC line (JMUi001-A-1) to mimic dilated cardiomyopathy with ataxia (DCMA) caused by a homozygous DNAJC19 mutation

2020· article· en· W3034021106 sur OpenAlexaff
Anna Janz, Ruping Chen, Martina Regensburger, Yuichiro Ueda, Simone Rost, Eva Klopocki, Katharina Günther, Frank Edenhofer, Henry J. Duff, Süleyman Ergün, Brenda Gerull

Notice bibliographique

RevueStem Cell Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of CalgaryLibin Cardiovascular Institute of Alberta
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und Forschung
Mots-clésInduced pluripotent stem cellBiologyGerm layerSendai virusCRISPRAtaxiaReprogrammingKaryotypeMutationDilated cardiomyopathyCardiomyopathyCell cultureCell biologyMolecular biologyCancer researchGeneticsInternal medicineEmbryonic stem cellCellChromosomeHeart failureGeneNeuroscienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dilated cardiomyopathy with ataxia (DCMA) is an autosomal recessive disorder arising from mutations in DNAJC19. Two patient-derived dermal fibroblast cell lines of siblings with the same homozygous splice acceptor site mutation in DNAJC19 (NM_145261.4):c.130-1G>C were reprogrammed into induced pluripotent stem cell (iPSC) lines (LIBUCi001-A and LIBUCi002-A) using non-integrative Sendai virus. Additionally, a third DNAJC19tv (truncation variant) iPSC line (JMUi001-A-1) was generated by CRISPR/Cas9 in healthy control iPSCs (JMUi001-A). All three DCMA iPSC lines present normal karyotypes, high expression of pluripotency markers and the capacity to differentiate into cells of all three germ layers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,917

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueStem Cell ResearchMême sujetCRISPR and Genetic EngineeringTravaux en français237 207